MYF5
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| MYF5, bHLHc2, myogenic factor 5, EORVA |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 159990 MGI: 97252 HomoloGene: 4085 GeneCards: MYF5
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • E-box binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента |
• нуклеоплазма • RNA polymerase II transcription regulator complex • клітинне ядро
|
---|
Біологічний процес |
• somitogenesis • embryonic skeletal system morphogenesis • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • muscle organ morphogenesis • осифікація • positive regulation of muscle cell differentiation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • muscle cell fate commitment • muscle organ development • extracellular matrix organization • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of skeletal muscle fiber development • transcription, DNA-templated • regulation of cell-matrix adhesion • multicellular organism development • positive regulation of myoblast fusion • positive regulation of myoblast differentiation • muscle tissue morphogenesis • skeletal muscle cell differentiation • camera-type eye development • skeletal muscle tissue development • cartilage condensation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 12: 80.72 – 80.72 Mb
| Хр. 10: 107.32 – 107.32 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
MYF5 (англ. Myogenic factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 255 амінокислот, а молекулярна маса — 28 296[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDVMDGCQFS | | PSEYFYDGSC | | IPSPEGEFGD | | EFVPRVAAFG | | AHKAELQGSD |
EDEHVRAPTG | | HHQAGHCLMW | | ACKACKRKST | | TMDRRKAATM | | RERRRLKKVN |
QAFETLKRCT | | TTNPNQRLPK | | VEILRNAIRY | | IESLQELLRE | | QVENYYSLPG |
QSCSEPTSPT | | SNCSDGMPEC | | NSPVWSRKSS | | TFDSIYCPDV | | SNVYATDKNS |
LSSLDCLSNI | | VDRITSSEQP | | GLPLQDLASL | | SPVASTDSQP | | ATPGASSSRL |
IYHVL |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, міогенез.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|