MYT1

MYT1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2JX1, 2JYD, 2MF8
Ідентифікатори
Символи	MYT1, C20orf36, MTF1, MYTI, NZF2, PLPB1, ZC2HC4A, ZC2H2C1, myelin transcription factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600379 MGI: 1100535 HomoloGene: 3332 GeneCards: MYT1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • zinc ion binding; • зв'язування з іоном металу; • DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • нуклеоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• multicellular organism development; • нейробіологія розвитку; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • диференціація клітин; • transcription, DNA-templated; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	4661
	17932
	ENSG00000196132
	ENSMUSG00000010505
	Q01538
	Q8CFC2
	NM_004535
	NM_001171615; NM_001171616; NM_001171680; NM_008665
	NP_004526
	NP_001165086; NP_001165087; NP_001165151; NP_032691
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MYT1 (англ. Myelin transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 121 амінокислот, а молекулярна маса — 122 329^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSLENEDKRA	RTRSKALRGP	PETTAADLSC	PTPGCTGSGH	VRGKYSRHRS
LQSCPLAKKR	KLEGAEAEHL	VSKRKSHPLK	LALDEGYGVD	SDGSEDTEVK
DASVSDESEG	TLEGAEAETS	GQDEIHRPET	AEGRSPVKSH	FGSNPIGSAT
ASSKGSYSSY	QGIIATSLLN	LGQIAEETLV	EEDLGQAAKP	GPGIVHLLQE
AAEGAASEEG	EKGLFIQPED	AEEVVEVTTE	RSQDLCPQSL	EDAASEESSK
QKGILSHEEE	DEEEEEEEEE	EEEDEEEEEE	EEEEEEEEEE	EEEEEEEEEE
EEEEEEAAPD	VIFQEDTSHT	SAQKAPELRG	PESPSPKPEY	SVIVEVRSDD
DKDEDTHSRK	STVTDESEMQ	DMMTRGNLGL	LEQAIALKAE	QVRTVCEPGC
PPAEQSQLGL	GEPGKAAKPL	DTVRKSYYSK	DPSRAEKREI	KCPTPGCDGT
GHVTGLYPHH	RSLSGCPHKD	RIPPEILAMH	ENVLKCPTPG	CTGQGHVNSN
RNTHRSLSGC	PIAAAEKLAK	SHEKQQPQTG	DPSKSSSNSD	RILRPMCFVK
QLEVPPYGSY	RPNVAPATPR	ANLAKELEKF	SKVTFDYASF	DAQVFGKRML
APKIQTSETS	PKAFQCFDYS	QDAEAAHMAA	TAILNLSTRC	WEMPENLSTK
PQDLPSKSVD	IEVDENGTLD	LSMHKHRKRE	NAFPSSSSCS	SSPGVKSPDA
SQRHSSTSAP	SSSMTSPQSS	QASRQDEWDR	PLDYTKPSRL	REEEPEESEP
AAHSFASSEA	DDQEVSEENF	EERKYPGEVT	LTNFKLKFLS	KDIKKELLTC
PTPGCDGSGH	ITGNYASHRS	LSGCPLADKS	LRNLMAAHSA	DLKCPTPGCD
GSGHITGNYA	SHRSLSGCPR	AKKSGVKVAP	TKDDKEDPEL	MKCPVPGCVG
LGHISGKYAS	HRSASGCPLA	ARRQKEGSLN	GSSFSWKSLK	NEGPTCPTPG
CDGSGHANGS	FLTHRSLSGC	PRATFAGKKG	KLSGDEVLSP	KFKTSDVLEN
DEEIKQLNQE	IRDLNESNSE	MEAAMVQLQS	QISSMEKNLK	NIEEENKLIE
EQNEALFLEL	SGLSQALIQS	LANIRLPHME	PICEQNFDAY	VSTLTDMYSN
QDPENKDLLE	SIKQAVRGIQ	V

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kim J.G., Hudson L.D. (1992). Novel member of the zinc finger superfamily: a C2-HC finger that recognizes a glia-specific gene. Mol. Cell. Biol. 12: 5632—5639. PMID 1280325 DOI:10.1128/MCB.12.12.5632
Armstrong R.C., Kim J.G., Hudson L.D. (1995). Expression of myelin transcription factor I (MyTI), a 'zinc-finger' DNA-binding protein, in developing oligodendrocytes. Glia. 14: 303—321. PMID 8530187 DOI:10.1002/glia.440140407
Nielsen J.A., Berndt J.A., Hudson L.D., Armstrong R.C. (2004). Myelin transcription factor 1 (Myt1) modulates the proliferation and differentiation of oligodendrocyte lineage cells. Mol. Cell. Neurosci. 25: 111—123. PMID 14962745 DOI:10.1016/j.mcn.2003.10.001

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7622 (англ.) . Архів оригіналу за 28 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q01538 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7622 (англ.) . Архів оригіналу за 28 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q01538 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]