NFYC

NFYC
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1N1J, 4AWL, 4CSR
Ідентифікатори
Символи	NFYC, CBF-C, CBFC, H1TF2A, HAP5, HSM, NF-YC, nuclear transcription factor Y subunit gamma
Зовнішні ІД	OMIM: 605344 MGI: 107901 HomoloGene: 7440 GeneCards: NFYC
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein heterodimerization activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • transcription factor binding; • sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• CCAAT-binding factor complex; • protein-DNA complex; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • RNA polymerase II transcription regulator complex;
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase II; • згортання білків; • transcription, DNA-templated; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of cholesterol biosynthetic process; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	4802
	18046
	ENSG00000066136
	ENSMUSG00000032897
	Q13952
	P70353
NM_001142587; NM_001142588; NM_001142589; NM_001142590; NM_001308114;
	NM_001308115; NM_014223
NM_001048168; NM_001277095; NM_008692; NM_001357192; NM_001357193;
	NM_001357194
NP_001136059; NP_001136060; NP_001136061; NP_001136062; NP_001295043;
	NP_001295044; NP_055038
NP_001041633; NP_001264024; NP_032718; NP_001344121; NP_001344122;
	NP_001344123
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NFYC (англ. Nuclear transcription factor Y subunit gamma) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 458 амінокислот, а молекулярна маса — 50 302^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSTEGGFGGT	SSSDAQQSLQ	SFWPRVMEEI	RNLTVKDFRV	QELPLARIKK
IMKLDEDVKM	ISAEAPVLFA	KAAQIFITEL	TLRAWIHTED	NKRRTLQRND
IAMAITKFDQ	FDFLIDIVPR	DELKPPKRQE	EVRQSVTPAE	PVQYYFTLAQ
QPTAVQVQGQ	QQGQQTTSST	TTIQPGQIII	AQPQQGQTTP	VTMQVGEGQQ
VQIVQAQPQG	QAQQAQSGTG	QTMQVMQQII	TNTGEIQQIP	VQLNAGQLQY
IRLAQPVSGT	QVVQGQIQTL	ATNAQQGQRN	ASQGKPRRCL	KETLQITQTE
VQQGQQQFSQ	FTDGQRNSVQ	QARVSELTGE	AEPREVKATG	NSTPCTSSLP
TTHPPSHRAG	ASCVCCSQPQ	QSSTSPPPSD	ALQWVVVEVS	GTPNQLETHR
ELHAPLPGMT	SLSPLHPSQQ	LYQIQQVTMP	AGQDLAQPMF	IQSANQPSDG
QAPQVTGD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Nakshatri H., Bhat-Nakshatri P., Currie R.A. (1996). Subunit association and DNA binding activity of the heterotrimeric transcription factor NF-Y is regulated by cellular redox. J. Biol. Chem. 271: 28784—28791. PMID 8910521 DOI:10.1074/jbc.271.46.28784
Dmitrenko V.V., Garifulin O.M., Kavsan V.M. (1997). Isolation and sequence analysis of the cDNA encoding subunit C of human CCAAT-binding transcription factor. Gene. 197: 161—163. PMID 9332362 DOI:10.1016/S0378-1119(97)00255-2
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Romier C., Cocchiarella F., Mantovani R., Moras D. (2003). The NF-YB/NF-YC structure gives insight into DNA binding and transcription regulation by CCAAT factor NF-Y. J. Biol. Chem. 278: 1336—1345. PMID 12401788 DOI:10.1074/jbc.M209635200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7806 (англ.) . Архів оригіналу за 24 березня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, Q13952 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7806 (англ.) . Архів оригіналу за 24 березня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q13952 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]