PPARD

PPARD
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1GWX, 1Y0S, 2AWH, 2B50, 2BAW, 2ENV, 2GWX, 2J14, 2Q5G, 2XYJ, 2XYW, 2XYX, 2ZNP, 2ZNQ, 3D5F, 3DY6, 3ET2, 3GWX, 3GZ9, 3OZ0, 3PEQ, 3SP9, 3TKM
Ідентифікатори
Символи	PPARD, FAAR, NR1C2, NUC1, NUCI, NUCII, PPARB, peroxisome proliferator activated receptor delta
Зовнішні ІД	OMIM: 600409 MGI: 101884 HomoloGene: 4544 GeneCards: PPARD
Пов'язані генетичні захворювання
цукровий діабет 2-го типу, diabetic cataract[1]
Реагує на сполуку
GW0742X, GW-501516, третиноїн, elafibranor, sodelglitazar, indeglitazar[2]
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • steroid hormone receptor activity • fatty acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • linoleic acid binding • protein heterodimerization activity • lipid binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • NF-kappaB binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • nuclear receptor coactivator activity • signaling receptor activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро • RNA polymerase II transcription regulator complex Біологічний процес • fatty acid catabolic process • positive regulation of myoblast proliferation • positive regulation of epidermis development • диференціація клітин • negative regulation of smooth muscle cell proliferation • negative regulation of myoblast differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • placenta development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of smooth muscle cell migration • Загоєння ран • mRNA transcription • cholesterol metabolic process • negative regulation of apoptotic process • response to glucose • response to activity • response to organic substance • generation of precursor metabolites and energy • regulation of fat cell differentiation • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • response to vitamin A • heart development • cell-substrate adhesion • keratinocyte proliferation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • proteoglycan metabolic process • regulation of cell population proliferation • negative regulation of cell growth • fatty acid oxidation • positive regulation of cell population proliferation • glucose metabolic process • phospholipid biosynthetic process • negative regulation of epithelial cell proliferation • positive regulation of skeletal muscle tissue regeneration • apoptotic signaling pathway • vitamin A metabolic process • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • keratinocyte migration • adipose tissue development • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • regulation of skeletal muscle satellite cell proliferation • positive regulation of fat cell differentiation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of inflammatory response • cellular response to lipopolysaccharide • cellular response to hypoxia • negative regulation of collagen biosynthetic process • positive regulation of insulin secretion • steroid hormone mediated signaling pathway • GO:0097285 апоптоз • проліферація • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • intracellular receptor signaling pathway • axon ensheathment • decidualization • fatty acid transport • embryo implantation • negative regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • lipid metabolism • fatty acid beta-oxidation • glucose transmembrane transport • fatty acid metabolic process • multicellular organism development • hormone-mediated signaling pathway • negative regulation of cholesterol storage • regulation of lipid metabolic process • response to lipid • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5467	19015
Ensembl	ENSG00000112033	ENSMUSG00000002250
UniProt	Q03181	P35396
RefSeq (мРНК)	NM_001171818 NM_001171819 NM_001171820 NM_006238 NM_177435	NM_011145
RefSeq (білок)	NP_001165289 NP_001165290 NP_001165291 NP_006229 NP_803184	NP_035275
Локус (UCSC)	Хр. 6: 35.34 – 35.43 Mb	Хр. 17: 28.23 – 28.3 Mb
PubMed search	[3]	[4]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PPARD (англ. Peroxisome proliferator activated receptor delta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 441 амінокислот, а молекулярна маса — 49 903^[6].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEQPQEEAPE		VREEEEKEEV		AEAEGAPELN		GGPQHALPSS		SYTDLSRSSS
PPSLLDQLQM		GCDGASCGSL		NMECRVCGDK		ASGFHYGVHA		CEGCKGFFRR
TIRMKLEYEK		CERSCKIQKK		NRNKCQYCRF		QKCLALGMSH		NAIRFGRMPE
AEKRKLVAGL		TANEGSQYNP		QVADLKAFSK		HIYNAYLKNF		NMTKKKARSI
LTGKASHTAP		FVIHDIETLW		QAEKGLVWKQ		LVNGLPPYKE		ISVHVFYRCQ
CTTVETVREL		TEFAKSIPSF		SSLFLNDQVT		LLKYGVHEAI		FAMLASIVNK
DGLLVANGSG		FVTREFLRSL		RKPFSDIIEP		KFEFAVKFNA		LELDDSDLAL
FIAAIILCGD		RPGLMNVPRV		EAIQDTILRA		LEFHLQANHP		DAQYLFPKLL
QKMADLRQLV		TEHAQMMQRI		KKTETETSLH		PLLQEIYKDM		Y

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Kobayashi T., Kodani Y., Nozawa A., Endo Y., Sawasaki T. (2008). DNA-binding profiling of human hormone nuclear receptors via fluorescence correlation spectroscopy in a cell-free system. FEBS Lett. 582: 2737—2744. PMID 18619963 DOI:10.1016/j.febslet.2008.07.003
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з PPARD переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Peroxisome proliferator activated receptor delta переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
3. Human PubMed Reference:.
4. Mouse PubMed Reference:.
5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9235 (англ.) . Архів оригіналу за 10 травня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
6. UniProt, Q03181 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 6

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»