REST (ген)

REST
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи REST, Rest, 2610008J04Rik, AA407358, NRSF, XBR, REST4, WT6, RE1 silencing transcription factor, GINGF5, HGF5, DFNA27
Зовнішні ІД OMIM: 600571 MGI: 104897 HomoloGene: 4099 GeneCards: REST
Пов'язані генетичні захворювання
gingival fibromatosis 5[1]
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001193508
NM_005612
NM_001363453
NM_011263
RefSeq (білок)
NP_001180437
NP_005603
NP_001350382
NP_035393
Локус (UCSC) Хр. 4: 56.91 – 56.97 Mb Хр. 5: 77.41 – 77.43 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

REST (англ. RE1 silencing transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 097 амінокислот, а молекулярна маса — 121 872[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MATQVMGQSSGGGGLFTSSGNIGMALPNDMYDLHDLSKAELAAPQLIMLA
NVALTGEVNGSCCDYLVGEERQMAELMPVGDNNFSDSEEGEGLEESADIK
GEPHGLENMELRSLELSVVEPQPVFEASGAPDIYSSNKDLPPETPGAEDK
GKSSKTKPFRCKPCQYEAESEEQFVHHIRVHSAKKFFVEESAEKQAKARE
SGSSTAEEGDFSKGPIRCDRCGYNTNRYDHYTAHLKHHTRAGDNERVYKC
IICTYTTVSEYHWRKHLRNHFPRKVYTCGKCNYFSDRKNNYVQHVRTHTG
ERPYKCELCPYSSSQKTHLTRHMRTHSGEKPFKCDQCSYVASNQHEVTRH
ARQVHNGPKPLNCPHCDYKTADRSNFKKHVELHVNPRQFNCPVCDYAASK
KCNLQYHFKSKHPTCPNKTMDVSKVKLKKTKKREADLPDNITNEKTEIEQ
TKIKGDVAGKKNEKSVKAEKRDVSKEKKPSNNVSVIQVTTRTRKSVTEVK
EMDVHTGSNSEKFSKTKKSKRKLEVDSHSLHGPVNDEESSTKKKKKVESK
SKNNSQEVPKGDSKVEENKKQNTCMKKSTKKKTLKNKSSKKSSKPPQKEP
VEKGSAQMDPPQMGPAPTEAVQKGPVQVEPPPPMEHAQMEGAQIRPAPDE
PVQMEVVQEGPAQKELLPPVEPAQMVGAQIVLAHMELPPPMETAQTEVAQ
MGPAPMEPAQMEVAQVESAPMQVVQKEPVQMELSPPMEVVQKEPVQIELS
PPMEVVQKEPVKIELSPPIEVVQKEPVQMELSPPMGVVQKEPAQREPPPP
REPPLHMEPISKKPPLRKDKKEKSNMQSERARKEQVLIEVGLVPVKDSWL
LKESVSTEDLSPPSPPLPKENLREEASGDQKLLNTGEGNKEAPLQKVGAE
EADESLPGLAANINESTHISSSGQNLNTPEGETLNGKHQTDSIVCEMKMD
TDQNTRENLTGINSTVEEPVSPMLPPSAVEEREAVSKTALASPPATMAAN
ESQEIDEDEGIHSHEGSDLSDNMSEGSDDSGLHGARPVPQESSRKNAKEA
LAVKAAKGDFVCIFCDRSFRKGKDYSKHLNRHLVNVYYLEEAAQGQE

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • Schoenherr C.J., Anderson D.J. (1995). The neuron-restrictive silencer factor (NRSF): a coordinate repressor of multiple neuron-specific genes. Science. 267: 1360—1363. PMID 7871435 DOI:10.1126/science.7871435
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Palm K., Metsis M., Timmusk T. (1999). Neuron-specific splicing of zinc finger transcription factor REST/NRSF/XBR is frequent in neuroblastomas and conserved in human, mouse and rat. Brain Res. Mol. Brain Res. 72: 30—39. PMID 10521596 DOI:10.1016/S0169-328X(99)00196-5
  • Nomura M., Uda-Tochio H., Murai K., Mori N., Nishimura Y. (2005). The neural repressor NRSF/REST binds the PAH1 domain of the Sin3 corepressor by using its distinct short hydrophobic helix. J. Mol. Biol. 354: 903—915. PMID 16288918 DOI:10.1016/j.jmb.2005.10.008
  • Scholl T., Stevens M.B., Mahanta S., Strominger J.L. (1996). A zinc finger protein that represses transcription of the human MHC class II gene, DPA. J. Immunol. 156: 1448—1457. PMID 8568247

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Захворювання, генетично пов'язані з REST переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9966 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  5. UniProt, Q13127 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]