RFX4

RFX4
Ідентифікатори
Символи	RFX4, NYD-SP10, regulatory factor X4
Зовнішні ІД	OMIM: 603958 MGI: 1918387 HomoloGene: 31119 GeneCards: RFX4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • forebrain development • telencephalon development • dorsal spinal cord development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of smoothened signaling pathway involved in ventral spinal cord patterning • cerebellar cortex morphogenesis • midbrain development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of protein processing • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • cilium assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5992	71137
Ensembl	ENSG00000111783	ENSMUSG00000020037
UniProt	Q33E94	Q7TNK1
RefSeq (мРНК)	NM_213594 NM_001206691 NM_002920 NM_032491	NM_001024918 NM_027689
RefSeq (білок)	NP_001193620 NP_115880 NP_998759	NP_001020089 NP_081965
Локус (UCSC)	Хр. 12: 106.58 – 106.76 Mb	Хр. 10: 84.59 – 84.74 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RFX4 (англ. Regulatory factor X4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 735 амінокислот, а молекулярна маса — 83 368^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHCGLLEEPD		MDSTESWIER		CLNESENKRY		SSHTSLGNVS		NDENEEKENN
RASKPHSTPA		TLQWLEENYE		IAEGVCIPRS		ALYMHYLDFC		EKNDTQPVNA
ASFGKIIRQQ		FPQLTTRRLG		TRGQSKYHYY		GIAVKESSQY		YDVMYSKKGA
AWVSETGKKE		VSKQTVAYSP		RSKLGTLLPE		FPNVKDLNLP		ASLPEEKVST
FIMMYRTHCQ		RILDTVIRAN		FDEVQSFLLH		FWQGMPPHML		PVLGSSTVVN
IVGVCDSILY		KAISGVLMPT		VLQALPDSLT		QVIRKFAKQL		DEWLKVALHD
LPENLRNIKF		ELSRRFSQIL		RRQTSLNHLC		QASRTVIHSA		DITFQMLEDW
RNVDLNSITK		QTLYTMEDSR		DEHRKLITQL		YQEFDHLLEE		QSPIESYIEW
LDTMVDRCVV		KVAAKRQGSL		KKVAQQFLLM		WSCFGTRVIR		DMTLHSAPSF
GSFHLIHLMF		DDYVLYLLES		LHCQERANEL		MRAMKGEGST		AEVREEIILT
EAAAPTPSPV		PSFSPAKSAT		SVEVPPPSSP		VSNPSPEYTG		LSTTGAMQSY
TWSLTYTVTT		AAGSPAENSQ		QLPCMRNTHV		PSSSVTHRIP		VYPHREEHGY
TGSYNYGSYG		NQHPHPMQSQ		YPALPHDTAI		SGPLHYAPYH		RSSAQYPFNS
PTSRMEPCLM		SSTPRLHPTP		VTPRWPEVPS		ANTCYTSPSV		HSARYGNSSD
MYTPLTTRRN		SEYEHMQHFP		GFAYINGEAS		TGWAK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9985 (англ.) . Архів оригіналу за 24 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-24 у Wayback Machine.]
4. UniProt, Q33E94 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 12

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»