RXRG

RXRG
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2GL8
Ідентифікатори
Символи	RXRG, NR2B3, RXRC, Retinoid X receptor gamma, RXR-gamma, RXRgamma
Зовнішні ІД	OMIM: 180247 MGI: 98216 HomoloGene: 21373 GeneCards: RXRG
Пов'язані генетичні захворювання
синдром набутого імунного дефіциту[1]
Реагує на сполуку
alitretinoin, bexarotene[2]
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • зв'язування з іоном металу • sequence-specific DNA binding • steroid hormone receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • retinoic acid receptor signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • protein homotetramerization • GO:0007329 positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in cellular response to chemical stimulus • transcription, DNA-templated • steroid hormone mediated signaling pathway • transcription initiation from RNA polymerase II promoter Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6258	20183
Ensembl	ENSG00000143171	ENSMUSG00000015843
UniProt	P48443	P28705
RefSeq (мРНК)	NM_001256570 NM_001256571 NM_006917	NM_001159731 NM_009107
RefSeq (білок)	NP_001243499 NP_001243500 NP_008848	NP_001153203 NP_033133
Локус (UCSC)	Хр. 1: 165.4 – 165.45 Mb	Хр. 1: 167.43 – 167.47 Mb
PubMed search	[3]	[4]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RXRG (англ. Retinoid X receptor gamma) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 463 амінокислот, а молекулярна маса — 50 871^[6].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYGNYSHFMK		FPAGYGGSPG		HTGSTSMSPS		AALSTGKPMD		SHPSYTDTPV
SAPRTLSAVG		TPLNALGSPY		RVITSAMGPP		SGALAAPPGI		NLVAPPSSQL
NVVNSVSSSE		DIKPLPGLPG		IGNMNYPSTS		PGSLVKHICA		ICGDRSSGKH
YGVYSCEGCK		GFFKRTIRKD		LIYTCRDNKD		CLIDKRQRNR		CQYCRYQKCL
VMGMKREAVQ		EERQRSRERA		ESEAECATSG		HEDMPVERIL		EAELAVEPKT
ESYGDMNMEN		STNDPVTNIC		HAADKQLFTL		VEWAKRIPHF		SDLTLEDQVI
LLRAGWNELL		IASFSHRSVS		VQDGILLATG		LHVHRSSAHS		AGVGSIFDRV
LTELVSKMKD		MQMDKSELGC		LRAIVLFNPD		AKGLSNPSEV		ETLREKVYAT
LEAYTKQKYP		EQPGRFAKLL		LRLPALRSIG		LKCLEHLFFF		KLIGDTPIDT
FLMEMLETPL		QIT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з RXRG переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Сполуки, які фізично взаємодіють з retinoid X receptor gamma переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
3. Human PubMed Reference:.
4. Mouse PubMed Reference:.
5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10479 (англ.) . Архів оригіналу за 8 липня 2017. Процитовано 25 серпня 2017. [Архівовано 2017-07-08 у Wayback Machine.]
6. UniProt, P48443 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 1

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»