SOX12

SOX12
Ідентифікатори
Символи	SOX12, SOX22, SRY-box 12, SRY-box transcription factor 12
Зовнішні ІД	OMIM: 601947 MGI: 98360 HomoloGene: 5057 GeneCards: SOX12
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • protein-DNA complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • компонент клітини Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • protein-DNA complex assembly • cell fate commitment • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • spinal cord development • transcription, DNA-templated • диференціація клітин Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6666	20667
Ensembl	ENSG00000177732	ENSMUSG00000051817
UniProt	O15370	Q04890
RefSeq (мРНК)	NM_006943	NM_011438
RefSeq (білок)	NP_008874	NP_035568
Локус (UCSC)	Хр. 20: 0.33 – 0.33 Mb	Хр. 2: 152.24 – 152.24 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SOX12 (англ. SRY-box 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 315 амінокислот, а молекулярна маса — 34 122^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVQQRGARAK		RDGGPPPPGP		GPAEEGAREP		GWCKTPSGHI		KRPMNAFMVW
SQHERRKIMD		QWPDMHNAEI		SKRLGRRWQL		LQDSEKIPFV		REAERLRLKH
MADYPDYKYR		PRKKSKGAPA		KARPRPPGGS		GGGSRLKPGP		QLPGRGGRRA
AGGPLGGGAA		APEDDDEDDD		EELLEVRLVE		TPGRELWRMV		PAGRAARGQA
ERAQGPSGEG		AAAAAAASPT		PSEDEEPEEE		EEEAAAAEEG		EEETVASGEE
SLGFLSRLPP		GPAGLDCSAL		DRDPDLQPPS		GTSHFEFPDY		CTPEVTEMIA
GDWRPSSIAD		LVFTY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11198 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
4. UniProt, O15370 (англ.) . Архів оригіналу за 1 жовтня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 20

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»