YBX1

YBX1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи YBX1, BP-8, CSDA2, CSDB, DBPB, MDR-NF1, NSEP-1, NSEP1, YB-1, YB1, CBF-A, EFI-A, Y-box binding protein 1
Зовнішні ІД OMIM: 154030 MGI: 99146 HomoloGene: 88707 GeneCards: YBX1
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_004559
NM_011732
RefSeq (білок)
NP_004550
NP_035862
Локус (UCSC) Хр. 1: 42.68 – 42.7 Mb Хр. 4: 119.14 – 119.15 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

YBX1 (англ. Y-box binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 324 амінокислот, а молекулярна маса — 35 924[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSSEAETQQPPAAPPAAPALSAADTKPGTTGSGAGSGGPGGLTSAAPAGG
DKKVIATKVLGTVKWFNVRNGYGFINRNDTKEDVFVHQTAIKKNNPRKYL
RSVGDGETVEFDVVEGEKGAEAANVTGPGGVPVQGSKYAADRNHYRRYPR
RRGPPRNYQQNYQNSESGEKNEGSESAPEGQAQQRRPYRRRRFPPYYMRR
PYGRRPQYSNPPVQGEVMEGADNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPP
RQRQPREDGNEEDKENQGDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDG
KETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, мітогенів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі. Також секретований назовні.

Література

[ред. | ред. код]
  • Sakura H., Maekawa T., Imamoto F., Yasuda K., Ishii S. (1988). Two human genes isolated by a novel method encode DNA-binding proteins containing a common region of homology. Gene. 73: 499—507. PMID 2977358 DOI:10.1016/0378-1119(88)90514-8
  • Didier D.K., Schiffenbauer J., Woulfe S.L., Zacheis M., Schwartz B.D. (1988). Characterization of the cDNA encoding a protein binding to the major histocompatibility complex class II Y box. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 7322—7326. PMID 3174636 DOI:10.1073/pnas.85.19.7322
  • Kolluri R., Kinniburgh A.J. (1991). Full length cDNA sequence encoding a nuclease-sensitive element DNA binding protein. Nucleic Acids Res. 19: 4771—4771. PMID 1891370 DOI:10.1093/nar/19.17.4771
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Capowski E.E., Esnault S., Bhattacharya S., Malter J.S. (2001). Y box-binding factor promotes eosinophil survival by stabilizing granulocyte-macrophage colony-stimulating factor mRNA. J. Immunol. 167: 5970—5976. PMID 11698476 DOI:10.4049/jimmunol.167.10.5970
  • Gaudreault I., Guay D., Lebel M. (2004). YB-1 promotes strand separation in vitro of duplex DNA containing either mispaired bases or cisplatin modifications, exhibits endonucleolytic activities and binds several DNA repair proteins. Nucleic Acids Res. 32: 316—327. PMID 14718551 DOI:10.1093/nar/gkh170

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8014 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. UniProt, P67809 (англ.) . Архів оригіналу за 3 лютого 2017. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]