ZFHX3

ZFHX3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DA1, 2DA2, 2DA3
Ідентифікатори
Символи	ZFHX3, ATBF1, ATBT, ZNF927, zinc finger homeobox 3
Зовнішні ІД	OMIM: 104155 MGI: 99948 HomoloGene: 21366 GeneCards: ZFHX3
Пов'язані генетичні захворювання
інсульт, ішемічна хвороба серця, синдром Кавасакі, цереброваскулярні хвороби[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • enzyme binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • ядерні тільця • transcription regulator complex • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • negative regulation of myoblast differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of locomotor rhythm • muscle organ development • transcription by RNA polymerase II • circadian regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of myoblast differentiation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • response to transforming growth factor beta • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • brain development • regulation of neuron differentiation • positive regulation of cell adhesion • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	463	11906
Ensembl	ENSG00000140836	ENSMUSG00000038872
UniProt	Q15911	Q61329
RefSeq (мРНК)	NM_001164766 NM_006885	NM_007496
RefSeq (білок)	NP_001158238 NP_008816	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 16: 72.78 – 73.89 Mb	Хр. 8: 108.67 – 109.69 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZFHX3 (англ. Zinc finger homeobox 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 703 амінокислот, а молекулярна маса — 404 419^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEGCDSPVVS		GKDNGCGIPQ		HQQWTELNST		HLPDKPSSME		QSTGESHGPL
DSLRAPFNER		LAESTASAGP		PSEPASKEVT		CNECSASFAS		LQTYMEHHCP
SARPPPPLRE		ESASDTGEEG		DEESDVENLA		GEIVYQPDGS		AYIVESLSQL
TQGGGACGSG		SGSGPLPSLF		LNSLPGAGGK		QGDPSCAAPV		YPQIINTFHI
ASSFGKWFEG		PDQAFPNTSA		LAGLSPVLHS		FRVFDVRHKS		NKDYLNSDGS
AKSSCVSKDV		PNNVDLSKFD		GFVLYGKRKP		ILMCFLCKLS		FGYVRSFVTH
AVHDHRMTLS		EDERKILSNK		NISAIIQGIG		KDKEPLVSFL		EPKNKNFQHP
LVSTANLIGP		GHSFYGKFSG		IRMEGEEALP		AGSAAGPEQP		QAGLLTPSTL
LNLGGLTSSV		LKTPITSVPL		GPLASSPTKS		SEGKDSGAAE		GEKQEVGDGD
CFSEKVEPAE		EEAEEEEEEE		EAEEEEEEEE		EEEEEEEDEG		CKGLFPSELD
EELEDRPHEE		PGAAAGSSSK		KDLALSNQSI		SNSPLMPNVL		QTLSRGTAST
SSNSASSFVV		FDGANRRNRL		SFNSEGVRAN		VAEGGRRLDF		ADESANKDNA
TAPEPNESTE		GDDGGFVPHH		QHAGSLCELG		VGECPSGSGV		ECPKCDTVLG
SSRSLGGHMT		MMHSRNSCKT		LKCPKCNWHY		KYQQTLEAHM		KEKHPEPGGS
CVYCKSGQPH		PRLARGESYT		CGYKPFRCEV		CNYSTTTKGN		LSIHMQSDKH
LNNMQNLQNG		GGEQVFSHTA		GAAAAAVAAA		AAAANISSSC		GAPSPTKPKT
KPTWRCEVCD		YETNVARNLR		IHMTSEKHMH		NMMLLQQNMT		QIQHNRHLGL
GSLPSPAEAE		LYQYYLAQNM		NLPNLKMDSA		ASDAQFMMSG		FQLDPAGPMA
AMTPALVGGE		IPLDMRLGGG		QLVSEELMNL		GESFIQTNDP		SLKLFQCAVC
NKFTTDNLDM		LGLHMNVERS		LSEDEWKAVM		GDSYQCKLCR		YNTQLKANFQ
LHCKTDKHVQ		KYQLVAHIKE		GGKANEWRLK		CVAIGNPVHL		KCNACDYYTN
SLEKLRLHTV		NSRHEASLKL		YKHLQQHESG		VEGESCYYHC		VLCNYSTKAK
LNLIQHVRSM		KHQRSESLRK		LQRLQKGLPE		EDEDLGQIFT		IRRCPSTDPE
EAIEDVEGPS		ETAADPEELA		KDQEGGASSS		QAEKELTDSP		ATSKRISFPG
SSESPLSSKR		PKTAEEIKPE		QMYQCPYCKY		SNADVNRLRV		HAMTQHSVQP
MLRCPLCQDM		LNNKIHLQLH		LTHLHSVAPD		CVEKLIMTVT		TPEMVMPSSM
FLPAAVPDRD		GNSNLEEAGK		QPETSEDLGK		NILPSASTEQ		SGDLKPSPAD
PGSVREDSGF		ICWKKGCNQV		FKTSAALQTH		FNEVHAKRPQ		LPVSDRHVYK
YRCNQCSLAF		KTIEKLQLHS		QYHVIRAATM		CCLCQRSFRT		FQALKKHLET
SHLELSEADI		QQLYGGLLAN		GDLLAMGDPT		LAEDHTIIVE		EDKEEESDLE
DKQSPTGSDS		GSVQEDSGSE		PKRALPFRKG		PNFTMEKFLD		PSRPYKCTVC
KESFTQKNIL		LVHYNSVSHL		HKLKRALQES		ATGQPEPTSS		PDNKPFKCNT
CNVAYSQSST		LEIHMRSVLH		QTKARAAKLE		AASGSSNGTG		NSSSISLSSS
TPSPVSTSGS		NTFTTSNPSS		AGIAPSSNLL		SQVPTESVGM		PPLGNPIGAN
IASPSEPKEA		NRKKLADMIA		SRQQQQQQQQ		QQQQQQQQQQ		QAQTLAQAQA
QVQAHLQQEL		QQQAALIQSQ		LFNPTLLPHF		PMTTETLLQL		QQQQHLLFPF
YIPSAEFQLN		PEVSLPVTSG		ALTLTGTGPG		LLEDLKAQVQ		VPQQSHQQIL
PQQQQNQLSI		AQSHSALLQP		SQHPEKKNKL		VIKEKEKESQ		RERDSAEGGE
GNTGPKETLP		DALKAKEKKE		LAPGGGSEPS		MLPPRIASDA		RGNATKALLE
NFGFELVIQY		NENKQKVQKK		NGKTDQGENL		EKLECDSCGK		LFSNILILKS
HQEHVHQNYF		PFKQLERFAK		QYRDHYDKLY		PLRPQTPEPP		PPPPPPPPPP
LPAAPPQPAS		TPAIPASAPP		ITSPTIAPAQ		PSVPLTQLSM		PMELPIFSPL
MMQTMPLQTL		PAQLPPQLGP		VEPLPADLAQ		LYQHQLNPTL		LQQQNKRPRT
RITDDQLRVL		RQYFDINNSP		SEEQIKEMAD		KSGLPQKVIK		HWFRNTLFKE
RQRNKDSPYN		FSNPPITSLE		ELKIDSRPPS		PEPPKQEYWG		SKRSSRTRFT
DYQLRVLQDF		FDANAYPKDD		EFEQLSNLLN		LPTRVIVVWF		QNARQKARKN
YENQGEGKDG		ERRELTNDRY		IRTSNLNYQC		KKCSLVFQRI		FDLIKHQKKL
CYKDEDEEGQ		DDSQNEDSMD		AMEILTPTSS		SCSTPMPSQA		YSAPAPSANN
TASSAFLQLT		AEAEELATFN		SKTEAGDEKP		KLAEAPSAQP		NQTQEKQGQP
KPELQQQEQP		EQKTNTPQQK		LPQLVSLPSL		PQPPPQAPPP		QCPLPQSSPS
PSQLSHLPLK		PLHTSTPQQL		ANLPPQLIPY		QCDQCKLAFP		SFEHWQEHQQ
LHFLSAQNQF		IHPQFLDRSL		DMPFMLFDPS		NPLLASQLLS		GAIPQIPASS
ATSPSTPTST		MNTLKRKLEE		KASASPGEND		SGTGGEEPQR		DKRLRTTITP
EQLEILYQKY		LLDSNPTRKM		LDHIAHEVGL		KKRVVQVWFQ		NTRARERKGQ
FRAVGPAQAH		RRCPFCRALF		KAKTALEAHI		RSRHWHEAKR		AGYNLTLSAM
LLDCDGGLQM		KGDIFDGTSF		SHLPPSSSDG		QGVPLSPVSK		TMELSPRTLL
SPSSIKVEGI		EDFESPSMSS		VNLNFDQTKL		DNDDCSSVNT		AITDTTTGDE
GNADNDSATG		IATETKSSSA		PNEGLTKAAM		MAMSEYEDRL		SSGLVSPAPS
FYSKEYDNEG		TVDYSETSSL		ADPCSPSPGA		SGSAGKSGDS		GDRPGQKRFR
TQMTNLQLKV		LKSCFNDYRT		PTMLECEVLG		NDIGLPKRVV		QVWFQNARAK
EKKSKLSMAK		HFGINQTSYE		GPKTECTLCG		IKYSARLSVR		DHIFSQQHIS
KVKDTIGSQL		DKEKEYFDPA		TVRQLMAQQE		LDRIKKANEV		LGLAAQQQGM
FDNTPLQALN		LPTAYPALQG		IPPVLLPGLN		SPSLPGFTPS		NTALTSPKPN
LMGLPSTTVP		SPGLPTSGLP		NKPSSASLSS		PTPAQATMAM		GPQQPPQQQQ
QQQQPQVQQP		PPPPAAQPPP		TPQLPLQQQQ		QRKDKDSEKV		KEKEKAHKGK
GEPLPVPKKE		KGEAPTATAA		TISAPLPTME		YAVDPAQLQA		LQAALTSDPT
ALLTSQFLPY		FVPGFSPYYA		PQIPGALQSG		YLQPMYGMEG		LFPYSPALSQ
ALMGLSPGSL		LQQYQQYQQS		LQEAIQQQQQ		RQLQQQQQQK		VQQQQPKASQ
TPVPPGAPSP		DKDPAKESPK		PEEQKNTPRE		VSPLLPKLPE		EPEAESKSAD
SLYDPFIVPK		VQYKLVCRKC		QAGFSDEEAA		RSHLKSLCFF		GQSVVNLQEM
VLHVPTGGGG		GGSGGGGGGG		GGGGGGGSYH		CLACESALCG		EEALSQHLES
ALHKHRTITR		AARNAKEHPS		LLPHSACFPD		PSTASTSQSA		AHSNDSPPPP
SAAAPSSASP		HASRKSWPQV		VSRASAAKPP		SFPPLSSSST		VTSSSCSTSG
VQPSMPTDDY		SEESDTDLSQ		KSDGPASPVE		GPKDPSCPKD		SGLTSVGTDT
FRL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, міогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Morinaga T., Yasuda H., Higashio K., Tamaoki T. (1991). A human alpha-fetoprotein enhancer-binding protein, ATBF1, contains four homeodomains and seventeen zinc fingers. Mol. Cell. Biol. 11: 6041—6049. PMID 1719379 DOI:10.1128/MCB.11.12.6041
• Sun X., Li J., Dong F.N., Dong J.T. (2014). Characterization of nuclear localization and SUMOylation of the ATBF1 transcription factor in epithelial cells. PLoS ONE. 9: E92746—E92746. PMID 24651376 DOI:10.1371/journal.pone.0092746

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з ZFHX3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:777 (англ.) . Архів оригіналу за 25 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-25 у Wayback Machine.]
5. UniProt, Q15911 (англ.) . Архів оригіналу за 20 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 16

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»