ZNF281
Ідентифікатори
Символи
ZNF281 , ZBP-99, ZNP-99, zinc finger protein 281, ZBP99, GZP1
Зовнішні ІД
MGI: 3029290 HomoloGene: 8270 GeneCards: ZNF281
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• нуклеоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес
• диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • embryonic body morphogenesis • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • stem cell differentiation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 1: 200.4 – 200.41 Mb
Хр. 1: 136.55 – 136.56 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
ZNF281 (англ. Zinc finger protein 281 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 895 амінокислот , а молекулярна маса — 96 915[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MKIGSGFLSG GGGTGSSGGS GSGGGGSGGG GGGGSSGRRA EMEPTFPQGM
VMFNHRLPPV TSFTRPAGSA APPPQCVLSS STSAAPAAEP PPPPAPDMTF
KKEPAASAAA FPSQRTSWGF LQSLVSIKQE KPADPEEQQS HHHHHHHHYG
GLFAGAEERS PGLGGGEGGS HGVIQDLSIL HQHVQQQPAQ HHRDVLLSSS
SRTDDHHGTE EPKQDTNVKK AKRPKPESQG IKAKRKPSAS SKPSLVGDGE
GAILSPSQKP HICDHCSAAF RSSYHLRRHV LIHTGERPFQ CSQCSMGFIQ
KYLLQRHEKI HSREKPFGCD QCSMKFIQKY HMERHKRTHS GEKPYKCDTC
QQYFSRTDRL LKHRRTCGEV IVKGATSAEP GSSNHTNMGN LAVLSQGNTS
SSRRKTKSKS IAIENKEQKT GKTNESQISN NINMQSYSVE MPTVSSSGGI
IGTGIDELQK RVPKLIFKKG SRKNTDKNYL NFVSPLPDIV GQKSLSGKPS
GSLGIVSNNS VETIGLLQST SGKQGQISSN YDDAMQFSKK RRYLPTASSN
SAFSINVGHM VSQQSVIQSA GVSVLDNEAP LSLIDSSALN AEIKSCHDKS
GIPDEVLQSI LDQYSNKSES QKEDPFNIAE PRVDLHTSGE HSELVQEENL
SPGTQTPSND KASMLQEYSK YLQQAFEKST NASFTLGHGF QFVSLSSPLH
NHTLFPEKQI YTTSPLECGF GQSVTSVLPS SLPKPPFGML FGSQPGLYLS
ALDATHQQLT PSQELDDLID SQKNLETSSA FQSSSQKLTS QKEQKNLESS
TGFQIPSQEL ASQIDPQKDI EPRTTYQIEN FAQAFGSQFK SGSRVPMTFI
TNSNGEVDHR VRTSVSDFSG YTNMMSDVSE PCSTRVKTPT SQSYR
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , диференціація, поліморфізм, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
Law D.J., Du M., Law G.L., Merchant J.L. (1999). ZBP-99 defines a conserved family of transcription factors and regulates ornithine decarboxylase gene expression. Biochem. Biophys. Res. Commun . 262 : 113—120. PMID 10448078 DOI :10.1006/bbrc.1999.1180
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Zhang X., Diab I.H., Zehner Z.E. (2003). ZBP-89 represses vimentin gene transcription by interacting with the transcriptional activator, Sp1. Nucleic Acids Res . 31 : 2900—2914. PMID 12771217 DOI :10.1093/nar/gkg380
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep . 10 : 1778—1791. PMID 25772364 DOI :10.1016/j.celrep.2015.02.033
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші