ZNF300
Ідентифікатори
Символи
ZNF300 , zinc finger protein 300
Зовнішні ІД
OMIM : 612429 HomoloGene: 56531 GeneCards: ZNF300
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• внутрішньоклітинний • клітинне ядро • ядерце
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 5: 150.89 – 150.9 Mb
н/д
PubMed search
[ 1]
н/д Вікідані
ZNF300 (англ. Zinc finger protein 300 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[ 2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 604 амінокислот , а молекулярна маса — 68 743[ 3] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MMKSQGLVSF KDVAVDFTQE EWQQLDPSQR TLYRDVMLEN YSHLVSMGYP
VSKPDVISKL EQGEEPWIIK GDISNWIYPD EYQADGRQDR KSNLHNSQSC
ILGTVSFHHK ILKGVTRDGS LCSILKVCQG DGQLQRFLEN QDKLFRQVTF
VNSKTVTEAS GHKYNPLGKI FQECIETDIS IQRFHKYDAF KKNLKPNIDL
PSCYKSNSRK KPDQSFGGGK SSSQSEPNSN LEKIHNGVIP FDDNQCGNVF
RNTQSLIQYQ NVETKEKSCV CVTCGKAFAK KSQLIVHQRI HTGKKPYDCG
ACGKAFSEKF HLVVHQRTHT GEKPYDCSEC GKAFSQKSSL IIHQRVHTGE
KPYECSECGK AFSQKSPLII HQRIHTGEKP YECRECGKAF SQKSQLIIHH
RAHTGEKPYE CTECGKAFCE KSHLIIHKRI HTGEKPYKCA QCEEAFSRKT
ELITHQLVHT GEKPYECTEC GKTFSRKSQL IIHQRTHTGE KPYKCSECGK
AFCQKSHLIG HQRIHTGEKP YICTECGKAF SQKSHLPGHQ RIHTGEKPYI
CAECGKAFSQ KSDLVLHQRI HTGERPYQCA ICGKAFIQKS QLTVHQRIHT
VVKS
Кодований геном білок за функцією належить до репресорів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг , поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
Cao Y., Li J.-X., Ji C.-N., Xu X.-W., Wu M. (2007). Molecular cloning and characterization of a novel splice variant of human ZNF300 gene, which expressed highly in testis. DNA Seq . 18 : 312—315. PMID 17541838 DOI :10.1080/10425170701243393
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші