ZNF346 (англ. Zinc finger protein 346 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 294 амінокислот , а молекулярна маса — 32 933[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MEYPAPATVQ AADGGAAGPY SSSELLEGQE PDGVRFDRER ARRLWEAVSG
AQPVGREEVE HMIQKNQCLF TNTQCKVCCA LLISESQKLA HYQSKKHANK
VKRYLAIHGM ETLKGETKKL DSDQKSSRSK DKNQCCPICN MTFSSPVVAQ
SHYLGKTHAK NLKLKQQSTK VEALHQNREM IDPDKFCSLC HATFNDPVMA
QQHYVGKKHR KQETKLKLMA RYGRLADPAV TDFPAGKGYP CKTCKIVLNS
IEQYQAHVSG FKHKNQSPKT VASSLGQIPM QRQPIQKDST TLED
Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , РНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
Yang M., May W.S., Ito T. (1999). JAZ requires the double-stranded RNA-binding zinc finger motifs for nuclear localization. J. Biol. Chem . 274 : 27399—27406. PMID 10488071 DOI :10.1074/jbc.274.39.27399
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Chen T., Brownawell A.M., Macara I.G. (2004). Nucleocytoplasmic shuttling of JAZ, a new cargo protein for exportin-5 . Mol. Cell. Biol . 24 : 6608—6619. PMID 15254228 DOI :10.1128/MCB.24.15.6608-6619.2004
Burge R.G., Martinez-Yamout M.A., Dyson H.J., Wright P.E. (2014). Structural characterization of interactions between the double-stranded RNA-binding zinc finger protein JAZ and nucleic acids. Biochemistry . 53 : 1495—1510. PMID 24521053 DOI :10.1021/bi401675h
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші