Ngày 27 tháng 10 năm 1962, Quốc hội ban hành Nghị quyết[3] về việc thành lập tỉnh Hà Bắc trên cơ sở tỉnh Bắc Giang và tỉnh Bắc Ninh. Khi đó, xã Phú Nhuận thuộc huyện Lục Ngạn, tỉnh Hà Bắc.
Ngày 6 tháng 11 năm 1996, Quốc hội ban hành Nghị quyết[4] về việc chia tỉnh Hà Bắc thành tỉnh Bắc Giang và tỉnh Bắc Ninh. Khi đó, xã Phú Nhuận thuộc huyện Lục Ngạn, tỉnh Bắc Giang.
Ngày 8 tháng 12 năm 2016, HĐND tỉnh Bắc Giang ban hành Nghị quyết số 41/NQ-HĐND[5] về việc:
Thành lập thôn Hợp Thành trên cơ sở thôn Phú Hà và thôn Suối Than.
Thành lập Thôn Khuôm trên cơ sở thôn Khuôm A và thôn Khuôm B.
Thành lập thôn Hòa Thanh trên cơ sở thôn Bãi Nơi và thôn Đèo Cỏ.
Ngày 8 tháng 12 năm 2017, HĐND tỉnh Bắc Giang ban hành Nghị quyết số 39/NQ-HĐND[6] về việc sáp nhập thôn Phú Thành vào thôn Thuận A.