Holozoa je također i stari naziv rodaDistaplia iz grupe Tunikati.[5]
Kako su holozoae kladus koji obuhvata sve organizme srodnije životinjama nego gljivama, neki autoriih prepoznaju kao parafiletsku grupu kao što je Choanozoa, koja se uglavnom sastoji od Holozoa, isključujući životinje.[6]
Najpoznatije Holozoa, osim životinja, vjerovatno su hoanoflagelati, koji su veoma slični ćelijama Porifera; čak od 19. stoljeća javljale su se i teorije da su povezani sa sunđerima. Moguće je da je dublje je poznavanje pripadnika roda Proterospongia, kao najupotrebljivijeg primjera kolonijalnih hoanoflagelata, moglo pouzanije proniknuti u porijeklo sunđera.
Do prepoznavanja bliskosti ostalih jednoćelijskih holozoa je došlo tokom 1990-tih.[7]
Grupa uglavnom parazitskih vrsta iz oblika zvanih Icthyosporea ili Mesomycetozoea ponekad se grupira zajedno sa drugim vrstama unutar Mesomycetozoa (uočljiva je razliku u sufiksu). Prema strukturi končastih pseudopodija, ameboidni rodovi Ministeria i Capsaspora mogu se spojiti u grupu zvanu Filasterea. Zajedno sa hoanoflagelatima, filasterea su vjerovatno blisko srodni životinjama, a jedna analiza ih je spojila u kladusFilozoa.[3]
Najnoviji kladogram je ukazao na moguće veze i odnose holozoa i ostalih grupa organizama,[9][10]
Ispod je prikazano filogenetsko stablo na bazi multigenske analize iz 2011. Označeno je i prije koliko miliona godina (Mya) je kladus divergirao u nove grane.[11][12][13]
^Tatiàn, Marcos; Antacli, Julieta Maria; Sahade, Ricardo (2005). "Ascidians (Tunicata, Ascidiacea): species distribution along the Scotia Arc". Scientia Marina. 69 (suppl. 2): 205–214.
^Torruella, Guifré; de Mendoza, Alex; Grau-Bové, Xavier; Antó, Meritxell; Chaplin, Mark A.; del Campo, Javier; Eme, Laura; Pérez-Cordón, Gregorio; Whipps, Christopher M. (21. 9. 2015). "Phylogenomics Reveals Convergent Evolution of Lifestyles in Close Relatives of Animals and Fungi". Current Biology (jezik: English). 25 (18): 2404–2410. doi:10.1016/j.cub.2015.07.053. ISSN0960-9822. PMID26365255.CS1 održavanje: nepoznati jezik (link)
^Hehenberger, Elisabeth; Tikhonenkov, Denis V.; Kolisko, Martin; Campo, Javier del; Esaulov, Anton S.; Mylnikov, Alexander P.; Keeling, Patrick J. (2017). "Novel Predators Reshape Holozoan Phylogeny and Reveal the Presence of a Two-Component Signaling System in the Ancestor of Animals". Current Biology. 27 (13): 2043–2050.e6. doi:10.1016/j.cub.2017.06.006. PMID28648822.