Tomozin

Tomozin
Identifikatori
Aliasi	STXBP5
Vanjski ID-jevi	OMIM: 604586 MGI: 1926058 HomoloGene: 16402 GeneCards: STXBP5
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 6 (čovjek)[1] Bend 6q24.3 Početak 147,204,417 bp[1] Kraj 147,390,476 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 10 (miš)[2] Bend 10|10 A1 Početak 9,755,547 bp[2] Kraj 9,901,079 bp[2]
Ontologija gena Molekularna funkcija • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • syntaxin-1 binding • syntaxin binding • myosin II binding Ćelijska komponenta • integral component of membrane • acetylcholine-gated channel complex • membrana • Sinapsna vezikula • ćelijska membrana • sinapsa • međućelijske veze • cytoplasmic vesicle membrane • GO:0016023 citoplazmatska vezikula • citosol • citoplazma • Nervno-mišićna veza • Schaffer collateral - CA1 synapse • extrinsic component of presynaptic membrane • presynaptic cytosol • SNARE complex Biološki proces • regulation of exocytosis • protein transport • positive regulation of exocytosis • vesicle-mediated transport • Egzocitoza • regulation of protein secretion • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • synaptic vesicle cycle Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	134957	78808
Ensembl	ENSG00000164506	ENSMUSG00000019790
UniProt	Q5T5C0	Q8K400
RefSeq (mRNK)	NM_001127715 NM_139244 NM_001394409	NM_001081344 NM_030191
RefSeq (bjelančevina)	NP_001121187 NP_640337	NP_001074813 NP_001394992 NP_001394993 NP_001394994
Lokacija (UCSC)	Chr 6: 147.2 – 147.39 Mb	Chr 10: 9.76 – 9.9 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

Sintaksin-vezujući protein 5 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom STXBP5 sa hromosoma 6. Također je poznat kao tomozin, po japanskom 友 = "prijatelj", zbog svoje uloge vezujućeg proteina.^[5][6][7]

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 1.151 aminokiselina, a molekulska težina 127.573 Da.^[7]

• C: Cistein
• D: Asparaginska kiselina
• E: Glutaminska kiselina
• F: Fenilalanin
• G: Glicin
• H: Histidin
• I: Izoleucin
• K: Lizin
• L: Leucin
• M: Metionin
• N: Asparagin
• P: Prolin
• Q: Glutamin
• R: Arginin
• S: Serin
• T: Treonin
• V: Valin
• W: Triptofan
• Y: Tirozin

10		20		30		40		50
MRKFNIRKVL		DGLTAGSSSA		SQQQQQQHPP		GNREPEIQET		LQSEHFQLCK
TVRHGFPYQP		SALAFDPVQK		ILAVGTQTGA		LRLFGRPGVE		CYCQHDSGAA
VIQLQFLINE		GALVSALADD		TLHLWNLRQK		RPAILHSLKF		CRERVTFCHL
PFQSKWLYVG		TERGNIHIVN		VESFTLSGYV		IMWNKAIELS		SKSHPGPVVH
ISDNPMDEGK		LLIGFESGTV		VLWDLKSKKA		DYRYTYDEAI		HSVAWHHEGK
QFICSHSDGT		LTIWNVRSPA		KPVQTITPHG		KQLKDGKKPE		PCKPILKVEF
KTTRSGEPFI		ILSGGLSYDT		VGRRPCLTVM		HGKSTAVLEM		DYSIVDFLTL
CETPYPNDFQ		EPYAVVVLLE		KDLVLIDLAQ		NGYPIFENPY		PLSIHESPVT
CCEYFADCPV		DLIPALYSVG		ARQKRQGYSK		KEWPINGGNW		GLGAQSYPEI
IITGHADGSV		KFWDASAITL		QVLYKLKTSK		VFEKSRNKDD		RPNTDIVDED
PYAIQIISWC		PESRMLCIAG		VSAHVIIYRF		SKQEVITEVI		PMLEVRLLYE
INDVETPEGE		QPPPLPTPVG		GSNPQPIPPQ		SHPSTSSSSS		DGLRDNVPCL
KVKNSPLKQS		PGYQTELVIQ		LVWVGGEPPQ		QITSLAVNSS		YGLVVFGNCN
GIAMVDYLQK		AVLLNLGTIE		LYGSNDPYRR		EPRSPRKSRQ		PSGAGLCDIS
EGTVVPEDRC		KSPTSGSSSP		HNSDDEQKMN		NFIEKVKTKS		RKFSKMVAND
IAKMSRKLSL		PTDLKPDLDV		KDNSFSRSRS		SSVTSIDKES		REAISALHFC
ETFTRKTDSS		PSPCLWVGTT		LGTVLVIALN		LPPGGEQRLL		QPVIVSPSGT
ILRLKGAILR		MAFLDTTGCL		IPPAYEPWRE		HNVPEEKDEK		EKLKKRRPVS
VSPSSSQEIS		ENQYAVICSE		KQAKVISLPT		QNCAYKQNIT		ETSFVLRGDI
VALSNSICLA		CFCANGHIMT		FSLPSLRPLL		DVYYLPLTNM		RIARTFCFTN
NGQALYLVSP		TEIQRLTYSQ		ETCENLQEML		GELFTPVETP		EAPNRGFFKG
LFGGGAQSLD		REELFGESSS		GKASRSLAQH		IPGPGGIEGV		KGAASGVVGE
LARARLALDE		RGQKLGDLEE		RTAAMLSSAE		SFSKHAHEIM		LKYKDKKWYQ
F

Struktura

Prvobitno su identificirane dva funkcionalna domena, uključujući jedan koji se veže za sintaksin, ali je nedavna kristalizacija homologa kvasca Sro7 otkrila da tomozin vjerovatno ima tri funkcionalna domena: jedan WD40 domen i jedan domen koji se veže za sintaksin, kao što je prethodno prepoznato, ali i drugi WD40 domen. Studija je također sugerirala da tomozinski 'sintaksin vezujući domen' nije razlog zašto tomozin inhibira oslobađanje neurotransmitera, kao što je prvobitno predloženo.^[8] Struktura zasnovana na Sro7 data je na SWISS-MODEL-u, koji uključuje WD40 domene, ali ne i većinu domena upredene zavojnice koji veže sintaksin vidljiv u infokutiji.^[9]

Funkcija

Sintaksin 1 je komponenta 7S i 20S SNARE kompleksa koji su uključeni u preradu i fuziju sinapsnih vezikula sa presinapsnom plazmamembranom. Ovaj gen kodira protein koji se vezuje za sintaksin 1. Kod pacova, sličan protein disocira sintaksin 1 od kompleksa Munc18/n-Sec1/rbSec1, da bi se formirao 10S kompleks, intermedijer koji se može konvertovati u 7S SNARE kompleks. Stoga se smatra da je ovaj protein uključen u oslobađanje neurotransmitera, stimulirajući formiranje SNARE kompleksa. Identificirane su alternativno prerađene varijante transkripta, ali njihova biološka valjanost nije utvrđena.^[7]

Poziciono kloniranje sugerira da tomozin može inhibirati lučenje neurotransmitera u neuronima Caenorhabditis elegans.^[10] Ova hipoteza je testirana i potvrđena, pokazujući da tomozin specifično inhibira primanje sinapsnih vezikula – biohemijski korak koji neposredno prethodi fuziji vezikula i oslobađanju neurotransmitera.^[11]

Interakcije

Pokazalo se da STXBP5 ima interakcije sa STX4^[12] i STX1A.^[5][12]

Reference

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000164506 - Ensembl, maj 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000019790 - Ensembl, maj 2017
3. "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
4. "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
5. Fujita Y, Shirataki H, Sakisaka T, Asakura T, Ohya T, Kotani H, Yokoyama S, Nishioka H, Matsuura Y, Mizoguchi A, Scheller RH, Takai Y (Jun 1998). "Tomosyn: a syntaxin-1-binding protein that forms a novel complex in the neurotransmitter release process". Neuron. 20 (5): 905–15. doi:10.1016/S0896-6273(00)80472-9. PMID 9620695. S2CID 12597505.
6. Katoh M, Katoh M (Feb 2004). "Identification and characterization of human LLGL4 gene and mouse Llgl4 gene in silico". Int. J. Oncol. 24 (3): 737–42. doi:10.3892/ijo.24.3.737. PMID 14767561.
7. "Entrez Gene: STXBP5 syntaxin binding protein 5 (tomosyn)".
8. Hattendorf DA, Andreeva A, Gangar A, Brennwald PJ, Weis WI (mart 2007). "Structure of the yeast polarity protein Sro7 reveals a SNARE regulatory mechanism". Nature. 446 (7135): 567–71. Bibcode:2007Natur.446..567H. doi:10.1038/nature05635. PMID 17392788. S2CID 4399611.
9. "Q5T5C0". SWISS-MODEL Repository.
10. Dybbs M, Ngai J, Kaplan JM (juli 2005). "Using microarrays to facilitate positional cloning: identification of tomosyn as an inhibitor of neurosecretion". PLOS Genet. 1 (1): 6–16. doi:10.1371/journal.pgen.0010002. PMC 1183521. PMID 16103915.
11. Gracheva EO, Burdina AO, Holgado AM, et al. (juli 2006). "Tomosyn inhibits synaptic vesicle priming in Caenorhabditis elegans". PLOS Biol. 4 (8): e261. doi:10.1371/journal.pbio.0040261. PMC 1514790. PMID 16895441.
12. Widberg CH, Bryant NJ, Girotti M, Rea S, James DE (Sep 2003). "Tomosyn interacts with the t-SNAREs syntaxin4 and SNAP23 and plays a role in insulin-stimulated GLUT4 translocation". J. Biol. Chem. 278 (37): 35093–101. doi:10.1074/jbc.M304261200. PMID 12832401.

Dopunska literatura

• Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). "Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks". Cell. 127 (3): 635–48. doi:10.1016/j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
• Widberg CH, Bryant NJ, Girotti M, Rea S, James DE (2003). "Tomosyn interacts with the t-SNAREs syntaxin4 and SNAP23 and plays a role in insulin-stimulated GLUT4 translocation". J. Biol. Chem. 278 (37): 35093–101. doi:10.1074/jbc.M304261200. PMID 12832401.
• Yokoyama S, Shirataki H, Sakisaka T, Takai Y (1999). "Three splicing variants of tomosyn and identification of their syntaxin-binding region". Biochem. Biophys. Res. Commun. 256 (1): 218–22. doi:10.1006/bbrc.1999.0300. PMID 10066450.

Vanjski linkovi