Noel Swerdlow, dans la biographie qu'il lui consacre pour la National Academy of Sciences le désigne comme « le savant le plus original et le plus productif en matière d'histoire des sciences exactes, et peut-être d'histoire de la science, de notre époque ».
Otto Eduard Neugebauer naît le à Innsbruck et grandit à Graz, en Autriche. Son père est ingénieur dans les chemins de fer. Il perd ses parents très jeune, et est élevé par son oncle. Au lycée, il est surtout intéressé par les matières scientifiques et techniques (dont le dessin technique et les mathématiques)[3]. En 1917, il s'engage dans l'armée autrichienne afin d'être exempté des épreuves de grec ancien[4]. Il est lieutenant dans l'artillerie, sur le front italien.
Au cours de ses études de mathématiques, Otto Neugebauer se prend de passion pour l'Égypte antique. En 1926, il publie sa thèse, qui concerne les fractions égyptiennes dans le papyrus Rhind. Il obtient un poste de Privatdozent à l'université en 1927 et commence à s'intéresser aux mathématiques mésopotamiennes. Il se marie avec Grete Bruck. Il apprend l'akkadien à Rome et entreprend des recherches pour découvrir des textes anciens et les publier. En 1928, il participe, à Leningrad, à la préparation de la publication du Papyrus de Moscou[6].
En 1929, il est l'un des cofondateurs de Quellen und Studien zur Geschichte der Mathematik, Astronomie und Physik, chez l'éditeur Springer, une collection dont le sujet est l'histoire des sciences et qui publie à la fois des sources et des analyses. Cette même année naît Margo, le premier enfant d'Otto et Grete Neugebauer. Ils auront un autre enfant Gerry Neugebauer, en 1932[6].
Otto Neugebauer fonde également la revue Zentralblatt für Mathematik und ihre Grenzgebiete en 1931, la collection de monographies Ergebnisse der Mathematik und ihrer Grenzgebiete en 1932 et Zentralblatt für Mechanik en 1933. Il est promu au grade de Extraordinarius en 1932[7].
En , Hitler est nommé chancelier, et en une loi, la loi des pleins pouvoirs, lui confère les pleins pouvoirs. Le , la loi sur la restauration de la fonction publique autorise l'exclusion des fonctionnaires juifs ou politiquement hostiles au nouveau régime. De nombreux scientifiques juifs, dont Emmy Noether, Edmund Landau et Richard Courant sont concernés, et s'exilent. Courant, avant de quitter ses fonctions, désigne Neugebauer pour lui succéder comme directeur de l'institut de mathématiques. Les nazis demandent à Neugebauer de signer un document affirmant sa loyauté envers le nouveau pouvoir. Celui-ci refuse. Ceci suffit pour le considérer comme politiquement insoutenable (« untragbar »). Il est suspendu de l'université et, comme à ses collègues juifs, l'accès-même aux bâtiments lui est interdit[8].
1985 : Priz Pfizer, conjointement avec Noel Swerdlow pour Mathematical Astronomy in Copernicus's De Revolutionibus
1986 : prix Balzan pour l'histoire de la science « pour les recherches fondamentales qu’il a menées dans le domaine des sciences exactes dans l’antiquité et, en particulier, pour ses travaux sur l’astronomie mésopotamienne, égyptienne et grecque qui ont ouvert de nouveaux horizons pour la connaissance des sciences dans l’antiquité et qui ont mis en lumière leur transmission aux mondes classique et médiéval. Pour sa contribution fondamentale au renouveau de l’histoire de la science et pour l’encouragement qu’il a donné aux recherches dans ce domaine »[9].
En son honneur, un prix Otto Neugebauer a été créé en Histoire des Mathématiques : il récompense un article ou un ouvrage ayant une grande influence.
"Studies in Ancient Astronomy. VIII. The Water Clock in Babylonian Astronomy." Isis, Vol. 37, No. 1/2, p. 37-43. (). JSTOR link. Reprinted in Neugebauer (1983), p. 239-245 (*).
(avec Richard A. Parker) "Egyptian Astronomical Texts: Iii. Decans, Planets, Constellations, and Zodiacs."
Astronomical Cuneiform Texts, 3 vol., Londres, 1955 ; 2e éd., New York, Springer, 1983 (couramment abrégé en ACT).
The Astronomical Tables of al-Khwarizmi. Historiskfilosofiske Skrifter undgivet af Det Kongelige Danske Videnskabernes Selskab, Bind 4, nr. 2. Copenhagen: Ejnar Munksgaard, 1962.
Ethiopic Astronomy and Computus, Vienne, Verlag der Österreichischen Akademie der Wissenschaften, 1979.
A History of Ancient Mathematical Astronomy, Springer Science & Business Media, , 1456 p. (ISBN978-3-540-06995-9, lire en ligne) (couramment abrégé en HAMA).
Astronomy and History: Selected Essays, New York, Springer, 1983.
↑(de) H. Bohr et O. Neugebauer, « Über lineare Differentialgleichungen mit konstanten Koeffizienten und fastperiodischer rechter Seite », Nachrichten von der Gesellschaft der Wissenschaften zu Göttingen, Mathematisch-Physikalische Klasse, , p. 8-22 (lire en ligne).
(en) Philip J. Davis, « Otto Neugebauer: Reminiscences and Appreciation », The American Mathematical Monthly, vol. 101, no 2, , p. 129-131 (DOI10.2307/2324359, JSTOR2324359)
(en) Noel M. Swerdlow, « Otto E. Neugebauer (26 May 1899-19 February 1990) », Proceedings of the American Philosophical Society, vol. 137, no 1, , p. 139–165 (ISSN0003-049X, lire en ligne)
(en) Joseph Warren Dauben et Christoph J. Scriba, « Neugebauer, Otto », dans Writing the history of mathematics: its historical development, Birkhäuser, (ISBN9783764361679)