Il Siófok fu fondato nel 1921 con il nome di Siófok SE. La parola Bodajk che fa parte del nome della squadra deriva da una fusione con il Bodajk FC avvenuta nel 2005.
Nel 1984 il Siófok (con il nome di Siófoki Bányász SE) ha vinto la Coppa d'Ungheria
battendo in finale il Rába Vasas ETO Gyõr (oggo Győri ETO) per 2-1, conquistando il suo primo e unico trofeo ufficiale.
In Europa partecipa alla Coppa delle Coppe nella stagione 1984/1985 venendo eliminato al primo turno dai greci del Larissa.
Per 5 volte partecipa all'Intertoto Cup (1986, 1989, 1990, 1991, 1992) non riuscendo mai a superare la fase a gironi.