MYO1C

MYO1C
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4BYF
Ідентифікатори
Символи	MYO1C, MMI-beta, MMIb, NMI, myr2, myosin IC, MyoIC
Зовнішні ІД	OMIM: 606538 MGI: 106612 HomoloGene: 32046 GeneCards: MYO1C
Онтологія гена Молекулярна функція • protein C-terminus binding • nucleotide binding • actin binding • signaling receptor binding • cytoskeletal motor activity • calmodulin binding • ATP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • microfilament motor activity • actin filament binding • microtubule motor activity • microtubule binding Клітинна компонента • екзосома • filamentous actin • brush border • ядерце • цитоплазма • ядерна пора • cell projection • гіалоплазма • клітинне ядро • stress fiber • stereocilium • unconventional myosin complex • Мікроворсинки • basal plasma membrane • мембрана • myosin I complex • ruffle • membrane raft • клітинна мембрана • myosin complex • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • stereocilium membrane • lateral plasma membrane • ruffle membrane • нуклеоплазма • ядерні тільця • stereocilium bundle • cytoplasmic vesicle membrane • phagocytic vesicle Біологічний процес • Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis • positive regulation of protein targeting to membrane • positive regulation of cell migration by vascular endothelial growth factor signaling pathway • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • positive regulation of cell migration • сортування білків • regulation of bicellular tight junction assembly • protein transport • protein targeting to membrane • mRNA transport • positive regulation of vascular endothelial growth factor signaling pathway • positive regulation of cellular response to insulin stimulus • positive regulation of actin filament polymerization • GO:0015915 транспорт • vesicle transport along actin filament • cellular response to interferon-gamma • microtubule-based movement Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4641	17913
Ensembl	ENSG00000197879	ENSMUSG00000017774
UniProt	O00159	Q9WTI7
RefSeq (мРНК)	NM_033375 NM_001080779 NM_001080950 NM_001363855	NM_001080774 NM_001080775 NM_008659 NM_001370611
RefSeq (білок)	NP_001074248 NP_001074419 NP_203693 NP_001350784	NP_001074243 NP_001074244 NP_032685 NP_001357540
Локус (UCSC)	Хр. 17: 1.46 – 1.49 Mb	Хр. 11: 75.54 – 75.56 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MYO1C (англ. Myosin IC) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 063 амінокислот, а молекулярна маса — 121 682^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALQVELVPT		GEIIRVVHPH		RPCKLALGSD		GVRVTMESAL		TARDRVGVQD
FVLLENFTSE		AAFIENLRRR		FRENLIYTYI		GPVLVSVNPY		RDLQIYSRQH
MERYRGVSFY		EVPPHLFAVA		DTVYRALRTE		RRDQAVMISG		ESGAGKTEAT
KRLLQFYAET		CPAPERGGAV		RDRLLQSNPV		LEAFGNAKTL		RNDNSSRFGK
YMDVQFDFKG		APVGGHILSY		LLEKSRVVHQ		NHGERNFHIF		YQLLEGGEEE
TLRRLGLERN		PQSYLYLVKG		QCAKVSSIND		KSDWKVVRKA		LTVIDFTEDE
VEDLLSIVAS		VLHLGNIHFA		ANEESNAQVT		TENQLKYLTR		LLSVEGSTLR
EALTHRKIIA		KGEELLSPLN		LEQAAYARDA		LAKAVYSRTF		TWLVGKINRS
LASKDVESPS		WRSTTVLGLL		DIYGFEVFQH		NSFEQFCINY		CNEKLQQLFI
ELTLKSEQEE		YEAEGIAWEP		VQYFNNKIIC		DLVEEKFKGI		ISILDEECLR
PGEATDLTFL		EKLEDTVKHH		PHFLTHKLAD		QRTRKSLGRG		EFRLLHYAGE
VTYSVTGFLD		KNNDLLFRNL		KETMCSSKNP		IMSQCFDRSE		LSDKKRPETV
ATQFKMSLLQ		LVEILQSKEP		AYVRCIKPND		AKQPGRFDEV		LIRHQVKYLG
LLENLRVRRA		GFAYRRKYEA		FLQRYKSLCP		ETWPTWAGRP		QDGVAVLVRH
LGYKPEEYKM		GRTKIFIRFP		KTLFATEDAL		EVRRQSLATK		IQAAWRGFHW
RQKFLRVKRS		AICIQSWWRG		TLGRRKAAKR		KWAAQTIRRL		IRGFVLRHAP
RCPENAFFLD		HVRTSFLLNL		RRQLPQNVLD		TSWPTPPPAL		REASELLREL
CIKNMVWKYC		RSISPEWKQQ		LQQKAVASEI		FKGKKDNYPQ		SVPRLFISTR
LGTDEISPRV		LQALGSEPIQ		YAVPVVKYDR		KGYKPRSRQL		LLTPNAVVIV
EDAKVKQRID		YANLTGISVS		SLSDSLFVLH		VQRADNKQKG		DVVLQSDHVI
ETLTKTALSA		NRVNSININQ		GSITFAGGPG		RDGTIDFTPG		SELLITKAKN
GHLAVVAPRL		NSR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білкових моторів, міозинів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, молекулою актину, молекулою кальмодуліну. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, комплексі ядерної пори.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cisterna B., Necchi D., Prosperi E., Biggiogera M. (2006). Small ribosomal subunits associate with nuclear myosin and actin in transit to the nuclear pores. FASEB J. 20: 1901—1903. PMID 16877530 DOI:10.1096/fj.05-5278fje
• Cavellan E., Asp P., Percipalle P., Oestlund Farrants A.-K. (2006). The WSTF-SNF2h chromatin remodeling complex interacts with several nuclear proteins in transcription. J. Biol. Chem. 281: 16264—16271. PMID 16603771 DOI:10.1074/jbc.M600233200
• Ihnatovych I., Migocka-Patrzalek M., Dukh M., Hofmann W.A. (2012). Identification and characterization of a novel myosin Ic isoform that localizes to the nucleus. Cytoskeleton. 69: 555—565. PMID 22736583 DOI:10.1002/cm.21040
• Stefan Munnich M.H., Manstein D.J. (2014). Crystal structure of human myosin 1c - the motor in GLUT4 exocytosis: implications for Ca(2+)-regulation and 14-3-3 binding. J. Mol. Biol. 426: 2070—2081. PMID 24636949 DOI:10.1016/j.jmb.2014.03.004

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7597 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
4. UniProt, O00159 (англ.) . Архів оригіналу за 5 лютого 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 17

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»