MYO5B

MYO5B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4J5M, 4LNZ, 4LWZ, 4LX0
Ідентифікатори
Символи	MYO5B, myosin VB, MVID1, DIAR2, PFIC10
Зовнішні ІД	OMIM: 606540 MGI: 106598 HomoloGene: 49481 GeneCards: MYO5B
Пов'язані генетичні захворювання
microvillus inclusion disease[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • calmodulin binding • microfilament motor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin binding • cytoskeletal motor activity • ATP binding • actin filament binding Клітинна компонента • цитоплазма • recycling endosome • apical cortex • екзосома • cytoplasmic vesicle membrane • myosin complex • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • renal water homeostasis • protein transport • vesicle-mediated transport • GO:0015915 транспорт • endosomal transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4645	17919
Ensembl	ENSG00000167306	ENSMUSG00000025885
UniProt	Q9ULV0	P21271
RefSeq (мРНК)	NM_001080467	NM_008661 NM_201600
RefSeq (білок)	NP_001073936	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 18: 49.82 – 50.2 Mb	Хр. 18: 74.57 – 74.9 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MYO5B (англ. Myosin VB) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 848 амінокислот, а молекулярна маса — 213 672^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSVGELYSQC		TRVWIPDPDE		VWRSAELTKD		YKEGDKSLQL		RLEDETILEY
PIDVQRNQLP		FLRNPDILVG		ENDLTALSYL		HEPAVLHNLK		VRFLESNHIY
TYCGIVLVAI		NPYEQLPIYG		QDVIYTYSGQ		NMGDMDPHIF		AVAEEAYKQM
ARDEKNQSII		VSGESGAGKT		VSAKYAMRYF		ATVGGSASET		NIEEKVLASS
PIMEAIGNAK		TTRNDNSSRF		GKYIQIGFDK		RYHIIGANMR		TYLLEKSRVV
FQADDERNYH		IFYQLCAAAG		LPEFKELALT		SAEDFFYTSQ		GGDTSIEGVD
DAEDFEKTRQ		AFTLLGVKES		HQMSIFKIIA		SILHLGSVAI		QAERDGDSCS
ISPQDVYLSN		FCRLLGVEHS		QMEHWLCHRK		LVTTSETYVK		TMSLQQVINA
RNALAKHIYA		QLFGWIVEHI		NKALHTSLKQ		HSFIGVLDIY		GFETFEVNSF
EQFCINYANE		KLQQQFNSHV		FKLEQEEYMK		EQIPWTLIDF		YDNQPCIDLI
EAKLGILDLL		DEECKVPKGT		DQNWAQKLYD		RHSSSQHFQK		PRMSNTAFII
VHFADKVEYL		SDGFLEKNRD		TVYEEQINIL		KASKFPLVAD		LFHDDKDPVP
ATTPGKGSSS		KISVRSARPP		MKVSNKEHKK		TVGHQFRTSL		HLLMETLNAT
TPHYVRCIKP		NDEKLPFHFD		PKRAVQQLRA		CGVLETIRIS		AAGYPSRWAY
HDFFNRYRVL		VKKRELANTD		KKAICRSVLE		NLIKDPDKFQ		FGRTKIFFRA
GQVAYLEKLR		ADKFRTATIM		IQKTVRGWLQ		KVKYHRLKGA		TLTLQRYCRG
HLARRLAEHL		RRIRAAVVLQ		KHYRMQRARQ		AYQRVRRAAV		VIQAFTRAMF
VRRTYRQVLM		EHKATTIQKH		VRGWMARRHF		QRLRDAAIVI		QCAFRMLKAR
RELKALRIEA		RSAEHLKRLN		VGMENKVVQL		QRKIDEQNKE		FKTLSEQLSV
TTSTYTMEVE		RLKKELVHYQ		QSPGEDTSLR		LQEEVESLRT		ELQRAHSERK
ILEDAHSREK		DELRKRVADL		EQENALLKDE		KEQLNNQILC		QSKDEFAQNS
VKENLMKKEL		EEERSRYQNL		VKEYSQLEQR		YDNLRDEMTI		IKQTPGHRRN
PSNQSSLESD		SNYPSISTSE		IGDTEDALQQ		VEEIGLEKAA		MDMTVFLKLQ
KRVRELEQER		KKLQVQLEKR		EQQDSKKVQA		EPPQTDIDLD		PNADLAYNSL
KRQELESENK		KLKNDLNELR		KAVADQATQN		NSSHGSPDSY		SLLLNQLKLA
HEELEVRKEE		VLILRTQIVS		ADQRRLAGRN		AEPNINARSS		WPNSEKHVDQ
EDAIEAYHGV		CQTNSKTEDW		GYLNEDGELG		LAYQGLKQVA		RLLEAQLQAQ
SLEHEEEVEH		LKAQLEALKE		EMDKQQQTFC		QTLLLSPEAQ		VEFGVQQEIS
RLTNENLDLK		ELVEKLEKNE		RKLKKQLKIY		MKKAQDLEAA		QALAQSERKR
HELNRQVTVQ		RKEKDFQGML		EYHKEDEALL		IRNLVTDLKP		QMLSGTVPCL
PAYILYMCIR		HADYTNDDLK		VHSLLTSTIN		GIKKVLKKHN		DDFEMTSFWL
SNTCRLLHCL		KQYSGDEGFM		TQNTAKQNEH		CLKNFDLTEY		RQVLSDLSIQ
IYQQLIKIAE		GVLQPMIVSA		MLENESIQGL		SGVKPTGYRK		RSSSMADGDN
SYCLEAIIRQ		MNAFHTVMCD		QGLDPEIILQ		VFKQLFYMIN		AVTLNNLLLR
KDVCSWSTGM		QLRYNISQLE		EWLRGRNLHQ		SGAVQTMEPL		IQAAQLLQLK
KKTQEDAEAI		CSLCTSLSTQ		QIVKILNLYT		PLNEFEERVT		VAFIRTIQAQ
LQERNDPQQL		LLDAKHMFPV		LFPFNPSSLT		MDSIHIPACL		NLEFLNEV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білкових моторів, міозинів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, молекулою актину, молекулою кальмодуліну. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Erickson R.P., Larson-Thome K., Valenzuela R.K., Whitaker S.E., Shub M.D. (2008). Navajo microvillous inclusion disease is due to a mutation in MYO5B. Am. J. Med. Genet. A. 146A: 3117—3119. PMID 19006234 DOI:10.1002/ajmg.a.32605

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з MYO5B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7603 (англ.) . Архів оригіналу за 20 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
5. UniProt, Q9ULV0 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 18

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»