PPL

PPL
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4Q28
Ідентифікатори
Символи	PPL, periplakin
Зовнішні ІД	OMIM: 602871 MGI: 1194898 HomoloGene: 2026 GeneCards: PPL
Онтологія гена Молекулярна функція • structural constituent of cytoskeleton • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cadherin binding • structural molecule activity Клітинна компонента • цитоплазма • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • Десмосома • екзосома • цитоскелет • мембрана • мітохондрія • клітинне ядро • cornified envelope • гіалоплазма • Проміжні філаменти Біологічний процес • keratinization • cytoskeleton organization • cornification • response to mechanical stimulus • Загоєння ран • intermediate filament cytoskeleton organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5493	19041
Ensembl	ENSG00000118898	ENSMUSG00000039457
UniProt	O60437	Q9R269
RefSeq (мРНК)	NM_002705	NM_008909
RefSeq (білок)	NP_002696	NP_032935
Локус (UCSC)	Хр. 16: 4.88 – 4.96 Mb	Хр. 16: 4.9 – 4.95 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PPL (англ. Periplakin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 756 амінокислот, а молекулярна маса — 204 747^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNSLFRKRNK		GKYSPTVQTR		SISNKELSEL		IEQLQKNADQ		VEKNIVDTEA
KMQSDLARLQ		EGRQPEHRDV		TLQKVLDSEK		LLYVLEADAA		IAKHMKHPQG
DMIAEDIRQL		KERVTNLRGK		HKQIYRLAVK		EVDPQVNWAA		LVEEKLDKLN
NQSFGTDLPL		VDHQVEEHNI		FHNEVKAIGP		HLAKDGDKEQ		NSELRAKYQK
LLAASQARQQ		HLSSLQDYMQ		RCTNELYWLD		QQAKGRMQYD		WSDRNLDYPS
RRRQYENFIN		RNLEAKEERI		NKLHSEGDQL		LAAEHPGRNS		IEAHMEAVHA
DWKEYLNLLI		CEESHLKYME		DYHQFHEDVK		DAQELLRKVD		SDLNQKYGPD
FKDRYQIELL		LRELDDQEKV		LDKYEDVVQG		LQKRGQQVVP		LKYRRETPLK
PIPVEALCDF		EGEQGLISRG		YSYTLQKNNG		ESWELMDSAG		NKLIAPAVCF
VIPPTDPEAL		ALADSLGSQY		RSVRQKAAGS		KRTLQQRYEV		LKTENPGDAS
DLQGRQLLAG		LDKVASDLDR		QEKAITGILR		PPLEQGRAVQ		DSAERAKDLK
NITNELLRIE		PEKTRSTAEG		EAFIQALPGS		GTTPLLRTRV		EDTNRKYEHL
LQLLDLAQEK		VDVANRLEKS		LQQSWELLAT		HENHLNQDDT		VPESSRVLDS
KGQELAAMAC		ELQAQKSLLG		EVEQNLQAAK		QCSSTLASRF		QEHCPDLERQ
EAEVHKLGQR		FNNLRQQVER		RAQSLQSAKA		AYEHFHRGHD		HVLQFLVSIP
SYEPQETDSL		SQMETKLKNQ		KNLLDEIASR		EQEVQKICAN		SQQYQQAVKD
YELEAEKLRS		LLDLENGRRS		HVSKRARLQS		PATKVKEEEA		ALAAKFTEVY
AINRQRLQNL		EFALNLLRQQ		PEVEVTHETL		QRNRPDSGVE		EAWKIRKELD
EETERRRQLE		NEVKSTQEEI		WTLRNQGPQE		SVVRKEVLKK		VPDPVLEESF
QQLQRTLAEE		QHKNQLLQEE		LEALQLQLRA		LEQETRDGGQ		EYVVKEVLRI
EPDRAQADEV		LQLREELEAL		RRQKGAREAE		VLLLQQRVAA		LAEEKSRAQE
KVTEKEVVKL		QNDPQLEAEY		QQLQEDHQRQ		DQLREKQEEE		LSFLQDKLKR
LEKERAMAEG		KITVKEVLKV		EKDAATEREV		SDLTRQYEDE		AAKARASQRE
KTELLRKIWA		LEEENAKVVV		QEKVREIVRP		DPKAESEVAN		LRLELVEQER
KYRGAEEQLR		SYQSELEALR		RRGPQVEVKE		VTKEVIKYKT		DPEMEKELQR
LREEIVDKTR		LIERCDLEIY		QLKKEIQALK		DTKPQVQTKE		VVQEILQFQE
DPQTKEEVAS		LRAKLSEEQK		KQVDLERERA		SQEEQIARKE		EELSRVKERV
VQQEVVRYEE		EPGLRAEASA		FAESIDVELR		QIDKLRAELR		RLQRRRTELE
RQLEELERER		QARREAEREV		QRLQQRLAAL		EQEEAEAREK		VTHTQKVVLQ
QDPQQAREHA		LLRLQLEEEQ		HRRQLLEGEL		ETLRRKLAAL		EKAEVKEKVV
LSESVQVEKG		DTEQEIQRLK		SSLEEESRSK		RELDVEVSRL		EARLSELEFH
NSKSSKELDF		LREENHKLQL		ERQNLQLETR		RLQSEINMAA		TETRDLRNMT
VADSGTNHDS		RLWSLERELD		DLKRLSKDKD		LEIDELQKRL		GSVAVKREQR
ENHLRRSIVV		IHPDTGRELS		PEEAHRAGLI		DWNMFVKLRS		QECDWEEISV
KGPNGESSVI		HDRKSGKKFS		IEEALQSGRL		TPAQYDRYVN		KDMSIQELAV
LVSGQK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як кератинізація. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, мітохондрії, клітинних контактах.

Література

• Ruhrberg C., Hajibagheri M.A.N., Parry D.A.D., Watt F.M. (1997). Periplakin, a novel component of cornified envelopes and desmosomes that belongs to the plakin family and forms complexes with envoplakin. J. Cell Biol. 139: 1835—1849. PMID 9412476 DOI:10.1083/jcb.139.7.1835
• Aho S., McLean W.H.I., Li K., Uitto J. (1998). cDNA cloning, mRNA expression, and chromosomal mapping of human and mouse periplakin genes. Genomics. 48: 242—247. PMID 9521878 DOI:10.1006/geno.1997.5188
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beekman J.M., Bakema J.E., van de Winkel J.G.J., Leusen J.H.W. (2004). Direct interaction between FcgammaRI (CD64) and periplakin controls receptor endocytosis and ligand binding capacity. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 10392—10397. PMID 15229321 DOI:10.1073/pnas.0401217101

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9273 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
4. UniProt, O60437 (англ.) . Архів оригіналу за 2 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 16

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»