Abans de l'arribada dels espanyols el poblat era anomenat pels nadius "Atlizintla". El nom vol dir "al costat de l'aigua abundant", perquè el lloc es trobava al sud-oest de la península que es forma entre la desembocadura del riu Papaloapan i el sistema de llacunes sobre el Golf de Mèxic. A l'arribada dels espanyols va rebre el nom d'Alvarado, en nom del conqueridor Pedro de Alvarado. Cap a 1600 el poblat era conegut com a "San Cristóbal de Alvarado", en honor del Sant patró del poble. No es va trobar una data exacta, encara que a partir de començaments del segle xx la ciutat era àmpliament coneguda només com a "Alvarado".[2]
Les coordenades geogràfiques del Municipi de Alvarado (número 3 en el mapa) són: 18°46'LatitudNord, 95°46′LongitudOest a 10m sobre el nivell del mar. Es troba a la denominada "Regió del Papaloapan"; confina amb municipis pertanyents a la "Regió de Sotavento".[3]
El municipi es troba regat pels rius Papaloapan i Blanc, sent tots dos tributaris del complex de les llacunes d'Alvarado, constituït, de Nord a Sud, per les llacunes Camaronera, Buen País, Alvarado i Tlalixcoyan. Alhora, aquest conjunt de zones lacustres configura l'ecoregió dels Manglars d'Alvarado, la zona de manglars més septentrionals del Golf de Mèxic.[4]
1846, la vila rep el Títol de "Il·lustre" per la defensa del port durant la Intervenció de les tropes nord-americanes.
1847, es construeixen els forts de "El Fortín de Santa Teresa", "Fuerte Santa Bárbara", "Fuerte El Rosario", "El Fortín de la Unión" i "Punta del Sud".
1847, la vila és capturada per l'exèrcit invasor, durant la Guerra d'Intervenció.
1929, Tlacotalpan formula un testimoniatge de gratitud als auxilis i generositat prestats per Alvarado, en ocasió de la gran inundació que va sofrir aquest port.
1932, es filma "Redes", pel·lícula social. Mostra que i com es pesca a Alvarado. Musicalizada per Silvestre Revueltas. Els actors són veritables pescadors del lloc.
1944, s'honra a la ciutat amb el títol de "Generosa".
1946, se celebra el primer Centenari de la Defensa del Port durant la Guerra d'Intervenció amb els Estats Units.
1957, l'H. Congrés estatal atorga el Títol de "Heroica" a la Generosa Ciutat i Port d'Alvarado.
1963, Són inaugurats pel President de Mèxic el Pont i la fàbrica processadora de peixos i mariscs "Productos Pesqueros de Alvarado".
1979, s'inaugura la Casa de la Cultura "Narcís Serradell Sevilla".
1987, s'acaba la construcció i és desembarcada a les aigües del Riu Papaloapan la rèplica de la Nao Marigalante, una de les embarcacions que va utilitzar Cristóbal Colón en els seus viatges expedicionaris. La construcció va ser duta a terme per les drassanes locals d'Oscar Camarero, empresari local, a partir de la idea i concepte del navegant espanyol Vital Alsar. La padrina de la nau va ser l'actriu i doctora en lletres Alicia Rodríguez, portadora oficial de la "Bandera de la Pau".
2004, Per primera vegada en la seva història les eleccions municipals donen com a resultat el triomf d'un candidat no pertanyent al PRI.
2006, Un autobús de transport local va caure del pont de Alvarado a les aigües profundes del Riu Papaloapan, deixant com a saldo als seus set morts.
2008, S'inicia la construcció del trimarán Zamná que portarà un missatge de pau al món; la construcció va ser realitzada per Don Oscar Camarero, sota el subsidi del seu propietari, Don Manuel Díaz Rubio i capitanejada novament pel navegant càntabre Vital Alsar.
2009, El 25 de juliol parteix del port de Alvarado el trimarán Zamná.
2009, La matinada del 29 d'octubre es registra un sisme de 5,7 en l'escala de Richter a 14 km al nord-oest del cap de municipi a l'altura de la localitat de Bon País. Es registren danys menors en el Palau Municipal i construccions antigues, encara que danyant severament l'edifici anteriorment conegut com a "Saló la Medul·la" causant la seva ensulsiada el 8 de novembre per a la seva total demolició dies després.
2010, A causa de les inundacions ocasionades pel Riu Papaloapan, el 28 d'agost i el 27 de setembre del mateix any, Alvarado rep generosament a centenars de Tlacotalpenys damnificats. Aquestes inundacions són considerades les més grans de la història.
2011, El 6 de febrer de 2011 és novament reconeguda com a Generosa per part del Poble Tlacotalpeny per l'ajuda brindada als damnificats de les inundacions de l'any 2010 .
El municipi compta amb una extensió territorial de 840.63 km² i està conformat per 265 localitats.
Un port excel·lent per ser explotat com a port turístic i marítim a causa de la seva riquesa natural.