Biến thể Gamma SARS-CoV-2

Các quốc gia có ca nhiễm biến chủng Gamma kể từ ngày 21 tháng 4 năm 2021^[1]
Chú giải:

  1,000+

  500–999

  100–499

  2–99

  1

  0

Biến thể Gamma SARS-CoV-2, còn được gọi là dòng P.1, là một trong những biến thể của SARS-CoV-2, virus gây ra COVID-19^[2]. Biến thể này của SARS-CoV-2 được đặt tên là dòng P.1 và có 17 amino acid thay thế, mười trong số đó nằm trong protein gai của nó, bao gồm ba loại được chỉ định là cần quan tâm đặc biệt: N501Y, E484K và K417T.^[3][4] Biến thể SARS-CoV-2 này lần đầu tiên được Viện Các bệnh Truyền nhiễm Quốc gia (NIID), Nhật Bản phát hiện vào ngày 6 tháng 1 năm 2021 trong cơ thể bốn người đến Tokyo từ Amazonas, Brazil 4 ngày trước đó.^[3][5] Sau đó biến thể này được công bố đã có mặt phổ biến ở Brazil.^[3] Theo sơ đồ đặt tên đơn giản do Tổ chức Y tế Thế giới đề xuất, biến thể P.1 đã được đặt nhãn là biến thể Gamma, và được coi là một biến thể đáng lo ngại.^[6]

Biến thể này đã gây ra sự lây nhiễm trên diện rộng vào đầu năm 2021 ở thành phố Manaus, thủ phủ của bang Amazonas. Mặc dù thành phố này đã trải qua sự lây nhiễm trên diện rộng trước đó vào tháng 5 năm 2020,^[7] với một nghiên cứu,^[8] cho thấy tỷ lệ xuất hiện trong huyết thanh cao của các kháng thể đối với SARS-CoV-2, nhưng virus biến thể mới vẫn tiếp tục lây nhiễm.^[9] Một bài báo nghiên cứu đăng trên Tạp chí Khoa học chỉ ra rằng những người bị bệnh do virus biến thể P.1 có khả năng lây truyền và tử vong cao hơn so với những người bị nhiễm virus biến thể B.1.1.28.^[10]

Biến thể gamma bao gồm hai biến thể phụ khác nhau 28-AM-1 và 28-AM-2, cả hai đều mang đột biến K417T, E484K, N501Y và cả hai loại này đều phát triển độc lập với nhau trong cùng một vùng Amazonas của Brazil.^[11]

Biến thể này khác biệt đáng kể so với biến thể Zeta (dòng P.2) cũng đang lưu hành rộng rãi ở Brazil. Đặc biệt là biến thể Zeta chỉ mang đột biến E484K và không có hai đột biến nào khác cần quan tâm là N501Y và K417T.^[11][12]

Tham khảo

1. “Lineage P.1”. cov-lineages.org. Truy cập ngày 21 tháng 4 năm 2021.
2. Newey, Sarah (ngày 12 tháng 1 năm 2021). “Third concerning coronavirus variant should be a 'wake up call' to the world, experts warn”. The Telegraph. Truy cập ngày 17 tháng 1 năm 2021.
3. ^ Faria, Nuno R.; Claro, Ingra Morales (12 tháng 1 năm 2021). “Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings”. Virological (bằng tiếng Anh). Truy cập ngày 23 tháng 1 năm 2021.
4. Covid-19 Genomics UK Consortium (ngày 15 tháng 1 năm 2021). “COG-UK Report on SARS-CoV-2 Spike mutations of interest in the UK” (PDF). www.cogconsortium.uk. Truy cập ngày 25 tháng 1 năm 2021.
5. “Japan finds new coronavirus variant in travelers from Brazil”. Japan Today. Japan. ngày 11 tháng 1 năm 2021. Truy cập ngày 14 tháng 1 năm 2021.
6. “Tracking SARS-CoV-2 variants”. www.who.int (bằng tiếng Anh). Truy cập ngày 1 tháng 6 năm 2021.
7. Matt Rivers (28 tháng 1 năm 2021). “Is a new coronavirus variant to blame for this Brazilian city's collapse?”. CNN.
8. Buss, Lewis F.; Prete, Carlos A.; Abrahim, Claudia M. M.; Mendrone, Alfredo; Salomon, Tassila; de Almeida-Neto, Cesar; và đồng nghiệp (ngày 8 tháng 12 năm 2020). “Three-quarters attack rate of SARS-CoV-2 in the Brazilian Amazon during a largely unmitigated epidemic”. Science. American Association for the Advancement of Science. 371 (6526): 288–292. doi:10.1126/science.abe9728. ISSN 0036-8075. PMC 7857406. PMID 33293339.
9. Sabino, Ester C.; Buss, Lewis F.; Carvalho, Maria P. S.; Prete, Carlos A.; Crispim, Myuki A. E.; Fraiji, Nelson A.; và đồng nghiệp (ngày 27 tháng 1 năm 2021). “Resurgence of COVID-19 in Manaus, Brazil, despite high seroprevalence”. The Lancet (bằng tiếng Anh). 397 (10273): 452–455. doi:10.1016/S0140-6736(21)00183-5. ISSN 0140-6736. PMC 7906746. PMID 33515491.
10. “Genomics and epidemiology of the P.1 SARS-CoV-2 lineage in Manaus, Brazil”. Science Magazine. ngày 31 tháng 5 năm 2021. Truy cập ngày 7 tháng 7 năm 2021.
11. ^ Oliver T.R. Toovey, Kirsty N. Harvey, Paul W. Bird, and Julian Wei-Tze Wei-Tze Tang (ngày 3 tháng 2 năm 2021). “Introduction of Brazilian SARS-CoV-2 484K.V2 related variants into the UK”. Journal of Infection. 82 (5): e23–e24. doi:10.1016/j.jinf.2021.01.025. PMC 7857057. PMID 33548358.
12. Covid-19 Genomics UK Consortium (ngày 15 tháng 1 năm 2021). “COG-UK Report on SARS-CoV-2 Spike mutations of interest in the UK” (PDF). www.cogconsortium.uk. Truy cập ngày 25 tháng 1 năm 2021.