Từ định danh margaritifer được ghép bởi hai âm tiết trong tiếng Latinh: margarita ("ngọc trai") và fero ("mang theo"), hàm ý đề cập đến các vệt đốm "màu xám như ngọc trai" ở dưới ổ mắt, trên má, ngực và xung quanh gốc vây ngực của loài cá này.[1]
P. margaritifer ban đầu được xếp vào chi Chromis, nhưng theo kết quả phân tích hình thái vào năm 2021 thì loài này đã được chuyển sang chi Pycnochromis.[2]
P. margaritifer có chiều dài cơ thể lớn nhất được ghi nhận là 10,2 cm.[4] Cơ thể có màu nâu sẫm, gần như đen ngoại trừ màu trắng ở toàn bộ đuôi và một phần cuối của vây lưng và vây hậu môn.[15] Kiểu màu nâu/trắng như vậy cũng được biết đến ở 3 loài Pycnochromis khác là Pycnochromis dimidiatus (đặc hữu của Biển Đỏ), Pycnochromis iomelas (Nam Thái Bình Dương) và Pycnochromis fieldi (Ấn Độ Dương); Tuy nhiên, phần màu trắng của 3 loài này đều chiếm đến nửa thân sau.[16]
Số gai ở vây lưng là 12; Số tia vây ở vây lưng là 12–13; Số gai ở vây hậu môn là 2; Số tia vây ở vây hậu môn là từ 11–12; Số tia vây ở vây ngực là từ 16–18; Số gai ở vây bụng là 1; Số tia vây ở vây bụng là 5; Số vảy đường bên là từ 16–18; Số lược mang là từ 25–29.[15]
Thức ăn của P. margaritifer là những loài động vật phù du. Chúng sống đơn độc hoặc theo từng nhóm nhỏ. Cá đực có tập tính bảo vệ và chăm sóc trứng; trứng có độ dính và bám vào nền tổ.[4]
^Tang, Kevin L.; Stiassny, Melanie L. J.; Mayden, Richard L.; DeSalle, Robert (2021). “Systematics of Damselfishes”. Ichthyology & Herpetology. 109 (1): 258–318. doi:10.1643/i2020105. ISSN2766-1512.
^R. Fricke; W. N. Eschmeyer; R. van der Laan biên tập (2023). “Chromis dimidiatus margaritifer”. Catalog of Fishes. Viện Hàn lâm Khoa học California. Truy cập ngày 20 tháng 2 năm 2022.