Отряд Пауки включает в себя два подотряда:
Mesothelae — включает всего одно семейство Liphistiidae
Opisthothelae — включает два инфраотряда:
По данным Всемирного каталога пауков на 8 августа 2017 года отряд делится на 37 надсемейств, 112 семейств, 4057 родов и 46 806 видов. Одиннадцать семейств имеют неопределенное положение — это значит, что их размещение в надсемействах, возможно, ошибочно.
Семейство, выделенное жирным шрифтом показывает, что в нём содержатся виды, являющиеся ядовитыми для человека.