John Merle Coulter (Ningbo, China, 20 de novembro de 1851 — 23 de dezembro de 1928) foi um botânico norte-americano.
Era irmão do biólogo Stanley Coulter (1853-1943). Fez seus estudos na Faculdade Hanover, em Indiana. Durante dois anos (1872-1873), foi botânico do Serviço Geológico dos Estados Unidos. Ensinou ciências naturais na Faculdade Hanover e em 1879 ensinou biologia na Faculdade Wabash.
Foi presidente da Universidade de Indiana de 1891 a 1893. Entre 1893 e 1896 presidiu à universidade de Lake Forest. Em 1896, deixa esta função para presidir o departamento de botânica da universidade de Chicago. Em 1875, coulter funda a Botanical Gazette.