Năm 1964, Yanofsky và các bạn đồng nghiệp đã chứng minh rằng các chuỗi gene và các chuỗi protein là đồng tuyến (colinear): nếu thay đổi ở chuỗi DNA thì có thể tạo ra thay đổi ở chuỗi protein ở các vị trí tương ứng. Việc nghiên cứu của ông đã khám phá ra vì sao các biến đổi được kiểm soát trong cấu trúc của RNA lại cho phép RNA được dùng như một phân tử điều chỉnh trong cả các tế bào vi khuẩn lẫn tế bào động vật.
Yanofsky, Charles (2007), “RNA-based regulation of genes of tryptophan synthesis and degradation, in bacteria.”, RNA, 13 (8), tr. 1141–54, doi:10.1261/rna.620507, PMID17601995
Yanofsky, Charles (2005), “The favorable features of tryptophan synthase for proving Beadle and Tatum's one gene-one enzyme hypothesis.”, Genetics, 169 (2), tr. 511–6, PMID15731515
Yanofsky, Charles (2004), “The different roles of tryptophan transfer RNA in regulating trp operon expression in E. coli versus B. subtilis.”, Trends Genet., 20 (8), tr. 367–74, doi:10.1016/j.tig.2004.06.007, PMID15262409
Yanofsky, C (2000), “Transcription attenuation: once viewed as a novel regulatory strategy.”, J. Bacteriol., 182 (1), tr. 1–8, doi:10.1128/JB.182.1.1-8.2000, PMID10613855
Yanofsky, C; Konan, K V; Sarsero, J P (1996), “Some novel transcription attenuation mechanisms used by bacteria.”, Biochimie, 78 (11–12), tr. 1017–24, doi:10.1016/S0300-9084(97)86725-9, PMID9150880
Yanofsky, C (1988), “Transcription attenuation.”, J. Biol. Chem., 263 (2), tr. 609–12, PMID3275656
Yanofsky, C; Platt, T; Crawford, I P; Nichols, B P (1981), “The complete nucleotide sequence of the tryptophan operon of Escherichia coli.”, Nucleic Acids Res., 9 (24), tr. 6647–68, doi:10.1093/nar/9.24.6647, PMID7038627
Yanofsky, C (1981), “Attenuation in the control of expression of bacterial operons.”, Nature, 289 (5800), tr. 751–8, doi:10.1038/289751a0, PMID7007895
Yanofsky, C (1971), “Tryptophan biosynthesis in Escherichia coli. Genetic determination of the proteins involved.”, JAMA, 218 (7), tr. 1026–35, doi:10.1001/jama.218.7.1026, PMID4940311
Yanofsky, C (1967), “Gene structure and protein structure.”, Harvey Lect., 61, tr. 145–68, PMID5338072