31 đội bóng đã đăng ký tham dự giải đấu lần này. Các đội bóng được chia sẵn thành hai nhóm dựa theo khu vực địa lý. Những đội bóng đóng vai trò là chủ nhà của bảng đấu vòng loại được đánh dấu bởi ký hiệu (H).
Lễ bốc thăm vòng loại Giải bóng đá Vô địch U-19 Quốc gia 2022 đã diễn ra vào lúc 09:30 ngày 18 tháng 1 năm 2022 tại trụ sở VFF, Hà Nội.[2]
Các đội thuộc cùng nhóm sẽ được phân đều vào các bảng, trong đó 20 đội nhóm 1 được chia thành 4 bảng 5 đội (các bảng A–D) và 11 đội nhóm 2 được chia thành bảng 5 đội (bảng E) và bảng 6 đội (bảng F). Các đội ở cùng hạng đấu (V.League, hạng Nhất, hạng Nhì, hạng Ba, trung tâm đào tạo...) cũng sẽ được chia đều vào các bảng, nhưng các đội ở cùng địa phương sẽ không được nằm chung bảng đấu.
Các đội thi đấu vòng tròn hai lượt tại địa điểm tập trung, tính điểm xếp hạng ở mỗi bảng. 6 đội xếp thứ nhất, 5 đội xếp thứ nhì có thành tích tốt nhất ở 6 bảng đấu sẽ lọt vào vòng chung kết. Trường hợp đội chủ nhà vòng chung kết kết thúc vòng loại với vị trí trong nhóm 11 đội nêu trên, đội nhì bảng thứ sáu cũng sẽ giành quyền tham dự vòng chung kết.
Các đội được xếp hạng theo điểm (3 điểm cho 1 trận thắng, 1 điểm cho 1 trận hòa, 0 điểm cho 1 trận thua), và nếu bằng điểm, các tiêu chí sau đây được áp dụng theo thứ tự, để xác định thứ hạng:[1]
Điểm trong các trận đối đầu trực tiếp giữa các đội bằng điểm;
Số bàn thắng ghi được trong các trận đối đầu trực tiếp giữa các đội bằng điểm;
Nếu có nhiều hơn hai đội bằng điểm, và sau khi áp dụng tất cả các tiêu chí đối đầu ở trên, một nhóm nhỏ các đội vẫn còn bằng điểm nhau, tất cả các tiêu chí đối đầu ở trên được áp dụng lại cho riêng nhóm này;
Hiệu số bàn thắng thua trong tất cả các trận đấu bảng;
Số bàn thắng ghi được trong tất cả các trận đấu bảng;
Sút luân lưu nếu chỉ có hai đội bằng điểm và họ gặp nhau trong trận cuối cùng của bảng;
Điểm kỷ luật (thẻ vàng = –1 điểm, thẻ đỏ gián tiếp (2 thẻ vàng) = –3 điểm, thẻ đỏ trực tiếp = –3 điểm, thẻ vàng và thẻ đỏ trực tiếp = –4 điểm);
Theo lịch được công bố ban đầu, các trận đấu thuộc lượt thứ nhất của bảng C diễn ra vào ngày 15 tháng 2 và lượt đấu thứ hai vào ngày 17 tháng 2. Tuy nhiên, vào ngày 14 tháng 2 năm 2022, VFF đã sắp xếp lại lịch thi đấu để chuyển các trận đấu của lượt 2 sang ngày 15 tháng 2 và lượt 1 vào ngày 17 tháng 2.[3] Việc hoán đổi tương tự cũng được thực hiện đối với các lượt trận 4 và 5 của bảng A và bảng C, diễn ra trong các ngày 23 và 25 tháng 2.[4]
Vào ngày 17 tháng 2 năm 2022, trận đấu ở bảng C giữa Khánh Hòa và Hà Nội được ban tổ chức thông báo là tạm hoãn do ảnh hưởng của dịch COVID-19. Cũng trong thông báo vào ngày 17 tháng 2, VFF đã quy định thời gian chậm nhất để tổ chức các trận đấu vòng loại trong trường hợp quá trình vòng loại bị kéo dài do ảnh hưởng của dịch bệnh là ngày 17 tháng 3 năm 2022; sau thời gian này, những trận đấu chưa thể diễn ra (do tạm hoãn) sẽ được coi là đã huỷ bỏ, đội bóng chưa thi đấu đủ số trận tại vòng loại tính đến lúc đó sẽ buộc phải rời khỏi giải và bị hủy toàn bộ kết quả thi đấu.[5]
Do Phú Thọ ở bảng B và Phú Yên ở bảng D rút lui sau khi bốc thăm, hai bảng đấu này chỉ còn lại bốn đội. Vì vậy, VFF đã sửa đổi lịch thi đấu để các bảng này được khởi tranh muộn hơn và tổ chức bốc thăm để xác định lại lịch thi đấu, với bảng B vào ngày 1 tháng 3 năm 2022[7] và bảng D vào ngày 5 tháng 3 năm 2022.[8][9] Vào ngày 28 tháng 2 năm 2022, hai trận đấu thuộc lượt thứ sáu gồm Hải Nam Vĩnh Yên Vĩnh Phúc gặp PVF ở bảng A và Hoàng Anh Gia Lai gặp Lâm Đồng ở bảng C đã bị hoãn lại, thay vào đó là trận đấu bù lượt 3 bảng A giữa Hải Nam Vĩnh Yên Vĩnh Phúc và Đắk Lắk.[10]
Vào ngày 1 tháng 3 năm 2022, VFF đã thông báo chuyển các trận đấu của lượt trận 9 bảng A sang ngày 2 tháng 3,[11] thay cho lượt 7 được diễn ra sau đó vào ngày 8 và 14 tháng 3.[12] Các trận đấu của lượt thứ tám của hai bảng A và C được chuyển sang ngày 6 tháng 3 thay vì 5 tháng 3, cùng hai trận đấu bù Khánh Hòa gặp Hà Nội và Lâm Đồng gặp Công an Nhân dân vào ngày 4 tháng 3.[13] Trận đấu vào ngày 4 tháng 3 giữa Bình Định và Hải Nam Vĩnh Yên Vĩnh Phúc, là trận đấu bù của ngày 25 tháng 2 ở bảng A,[14] tiếp tục bị dời lại đến ngày 8 tháng 3.[12]
Vào ngày 6 tháng 3 năm 2022, thêm một trận đấu tại bảng C giữa Hà Nội và Hoàng Anh Gia Lai bị hoãn, trong khi các trận đấu của lượt 8 bảng A được chuyển đến ngày 8 tháng 3[15] và lượt 10 vào ngày 10 tháng 3.[12] Các trận đấu thuộc lượt 9 bảng E gồm Becamex Bình Dương gặp Long An[12] và Thành phố Hồ Chí Minh gặp Tây Ninh[16] vào ngày 8 tháng 3, và cả lượt đấu 10 vào ngày 10 tháng 3 cũng được thông báo hoãn,[17] và được tổ chức lần lượt vào các ngày 14 và 16 tháng 3.[18] Các trận đấu thuộc lượt 10 bảng C được diễn ra vào ngày 14 tháng 3.[17]
Các cầu thủ sinh từ ngày 1 tháng 1 năm 2003 đến ngày 31 tháng 12 năm 2007 có đủ điều kiện để tham dự giải đấu. Mỗi đội bóng phải đăng ký một đội hình tối thiểu 18 cầu thủ và tối đa 30 cầu thủ, trong đó phải có tối thiểu 2 thủ môn (Quy định mục 6.2).[1]
Các trận đấu diễn ra tại Trung tâm Huấn luyện và thi đấu thể dục thể thao tỉnh Bình Phước.
Với việc Phú Thọ rút lui ở bảng B và Phú Yên rút lui ở bảng D, hai bảng đấu này chỉ còn lại bốn đội. Vì vậy, đội xếp thứ nhì của bảng F gồm 6 đội sẽ giành quyền vào vòng chung kết mà không cần phải xét thành tích với đội nhì bảng của năm bảng còn lại.[20]